大豆含硫氨基酸相关酶基因发掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邱红梅

作者： 邱红梅;郝文媛;高淑芹;马晓萍;郑宇宏;孟凡凡;范旭红;王洋;王跃强;王曙明

作者机构：

关键词： 大豆;含硫氨基酸;合成途径;酶基因;生物信息学

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2014 年 36 卷 09 期

页码： 934-942

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大豆(Glycine max)含硫氨基酸合成途径中的酶基因是含硫氨基酸组分的重要调控基因,发掘相关酶基因对高含硫氨基酸分子育种具有重要意义。文章采用大豆物理与遗传整合图谱,通过BioMercator2.1将113个含硫氨基酸合成途径酶基因及33个控制含硫氨基酸含量的QTL整合到遗传图谱Consensus Map 4.0上,依据酶基因位点与QTL的一致性以及QTL的效应值,初步筛选到16个与含硫氨基酸合成相关的候选基因。通过生物信息学方法对候选基因进行拷贝数、SNP、表达谱等分析,鉴定到12个相关酶基因,分别位于D1a、M、A2、K和G等8个连锁群上。生物信息学分析显示这些基因所在QTL可解释含硫氨基酸遗传变异的6.0%~38.5%,其中9个基因的间接效应值超过10%。12个相关酶基因参与含硫氨基酸代谢的重要途径,且多在子叶、花中高丰度表达,存在丰富的SNP。这些基因可作为候选基因进行功能标记开发,将为大豆分子设计育种奠定基础。

分类号： Q943.2

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