牦牛miR-378前体克隆及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 纪会

作者： 纪会;王会;柴志欣;王吉坤;罗晓林;姬秋梅;信金伟;钟金城

作者机构：

关键词： 牦牛;miR-378;克隆;组织表达;生物信息分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 58-66

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在克隆牦牛miR-378的前体序列,阐明其组织表达规律,结合bta-miR-378靶基因的生物信息学预测和分析,探讨miR-378在牦牛生长发育过程中的调控功能。采用PCR方法成功克隆类乌齐牦牛miR-378前体序列,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测miR-378-3p在各组织中的表达模式,结合生物信息学软件TargetScan、DAVID以及数据库NCBI、miRbase等对miR-378进行保守性分析、靶基因预测及其生物学功能分析。结果表明,miR-378在各物种间高度保守,且miR-378-3p在各组织中广泛表达,其中在臀大肌中表达水平最高,显著高于其他组织(P<0.01),在臀脂中的表达高于卵巢、大脑、乳腺和肝脏。获得的272个靶基因主要参与细胞分化、细胞发育、大分子代谢等多个生物学过程,涉及孕酮介导的卵母细胞成熟、促性腺激素释放激素(GnRH)信号通路等,由此推测,miR-378可能在卵泡发育、卵母细胞成熟过程中起关键作用,进而影响母牦牛的繁殖性能。

分类号： S823.85

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