甘薯Ib CHLI1基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高兵倩

作者： 高兵倩;王珧;刘洋;赵路宽;邓逸桐;曹清河;邹华文

作者机构：

关键词： 甘薯[Ipomoea batatas (L.) Lam.];镁离子螯合酶(MgCh);CHLI1;基因克隆;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 022 期

页码： 7327-7336

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 甘薯[Ipomoea batatas （L.） Lam.]是重要的粮食、保健、工业原料和能源作物，而一些甘薯品种因叶型或叶色丰富被作为观赏植物或绿化植物。CHLI1基因编码叶绿素合成途径中镁离子螯合酶（MgCh）的Chl I亚基，对叶绿素的合成以及叶绿体的发育至关重要，并影响植物叶片着色。本实验以‘徐薯29号’为材料，采用RT-PCR方法克隆CHLI1基因对其进行生物信息学分析，并进行了不同部位的表达模式分析。结果表明，甘薯IbCHLI1基因最大阅读框（ORF）长度为1 281 bp，编码426个氨基酸，蛋白质相对分子质量为46 184.90 Da，其分子式为C2032H3332N568O632S11，原子总数为6 575，理论等电点为5.68；该蛋白属于亲水性非分泌蛋白，定位在叶绿体中，稳定性较好，不存在跨膜结构域以及信号肽，有多个磷酸化位点；该蛋白二级结构主要包括α-螺旋（42.25%）、无规卷曲（35.21%）、延伸链（15.96%）和β-转角（6.57%），三级结构预测结果显示该蛋白含有核苷三磷酸水解酶的P-loop环，保守结构域预测结果显示该蛋白是含有AAA结构域的ATP结合蛋白，属于Chl I超家族；系统进化分析发现该蛋白与三裂叶野牵牛（Ipomoea triloba）的CHLI1蛋白亲缘关系最近，序列相似性达到99.30%。组织特异性表达分析结果显示Ib CHLI1基因在甘薯不同组织中存在明显的组织表达特异性，在叶片中表达量最高，在根中表达量最低。以上对IbCHLI1基因在甘薯中的初步分析将为后续利用基因工程手段创制观赏甘薯新种质提供理论依据。

分类号： S531

  • 相关文献

[1]甘蓝型油菜GPAT9基因克隆与生物信息学分析. 刘少锋,邬贤梦,官春云,熊兴华. 2016

[2]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016

[3]无芒隐子草SAMS1基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析. 孔令芳,张吉宇,刘志鹏,王彦荣. 2013

[4]中华蜜蜂GABARAP基因克隆、生物信息学分析及原核表达载体的构建. 于慧敏,吴鹏杰,李南南,谭静,徐书法,武江利. 2022

[5]小麦逆境胁迫相关基因TaCBL7的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,郑科,刘泽厚. 2013

[6]无芒隐子草CsPEAMT基因克隆及表达特性分析. 段珍,张吉宇,狄红艳,霍雅馨. 2014

[7]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020

[8]铁棍山药SUS基因CDS区克隆与生物信息学分析. 刘苏伟,文艺,张骆琪,高素霞,刘玉霞,王飞,鲁传涛,刘红彦. 2019

[9]野巴旦杏AlsCBF基因的克隆及生物信息学分析. 李宁,李疆,刘立强,罗淑萍. 2015

[10]水牛溶血磷脂酸受体3基因的克隆及生物信息学分析. 庞春英,梁莎莎,马小娅,邓廷贤,陆杏蓉,段安琴,黄韵琪,梁贤威. 2018

[11]中间锦鸡儿WRKY12基因克隆与生物信息学分析. 万东莉,张杰,王瑞刚,李国婧,万永青. 2020

[12]大刍草SAMS1基因克隆与生物信息学分析. 张玉荣,杨雅舒,申圣圣,王陆军,郭虹霞,邓妍,王创云,杨利艳. 2020

[13]大豆胞囊线虫病抗性候选基因GmPEBP4-1克隆及表达分析. 郭杨,陈立新,姜海鹏,战宇航. 2020

[14]小麦胁迫相关基因TaSF3B2的克隆及表达特性分析. 黄鑫,夏百成,龙翔宇. 2016

[15]木霉菌T23胶毒素合成基因的生物信息学分析与克隆. 何炼,蒋秋平,曾华兰,叶鹏盛,张敏,刘朝辉,韦树谷. 2019

[16]苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2022

[17]丹参SmWRKY33基因的克隆与表达分析. 龚婷,刘灵娣,温春秀,武玉翠,王升,万修福,孙亚倩,姜涛. 2024

[18]牛带绦虫8ku蛋白基因家族cDNA的克隆和序列分析. 王玉朝,贾万忠,闫鸿斌,郭爱疆,岳城. 2010

[19]鳜鱼嗜水气单胞菌GYK1株外膜蛋白A基因的克隆及其生物信息学分析. 付小哲,方翔,李宁求,林强,潘厚军,石存斌,黄志斌,吴淑勤. 2013

[20]杧果MiNPR1抗病基因克隆及生物信息学分析. 陈思宇,詹儒林,姜成东,柳凤,张国辉,姚全胜. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序