海南三亚斑节对虾野生种群mtDNA 16S rRNA基因和控制区序列的多态性

文献类型: 中文期刊

第一作者: 周发林

作者: 周发林;江世贵;姜永杰;黄建华;马之明

作者机构:

关键词: 斑节对虾;mtDNA;16S rRNA;控制区序列;遗传多样性

期刊名称: 南方水产

ISSN: 1673-2227

年卷期: 2006 年 2 卷 06 期

页码: 13-18

摘要: 采用聚合酶链式反应(PCR)技术对海南三亚野生斑节对虾(Penaeus monodon)20个个体的mtDNA 16S rRNA基因和控制区序列进行扩增,PCR产物经纯化后进行测序,得到16S rRNA基因的495 bp的核苷酸序列和控制区序列470 bp的核苷酸片段。用Clustal X软件对16S rRNA和控制区序列进行了比对,通过ARLEQUIN 2000软件对所得线粒体16S rRNA基因片段和控制区序列进行了比较分析。16S rRNA序列检测出17个多态位点,8种单倍型;控制区序列检测出100个多态位点,17种单倍型。该种群16S rRNA序列基因多样度(H)和碱基多样度(π)分别为0.700和0.0045;控制区序列的H和π分别为0.984和0.0480。研究结果表明:16S rRNA序列不适应斑节对虾的种群遗传多样性分析;控制区序列适应斑节对虾种群遗传多样性研究。

分类号: S917.4

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