水貂犬瘟热病毒微滴数字PCR检测方法的建立与应用

文献类型: 中文期刊

第一作者: 闫曼平

作者: 闫曼平;商金源;叶京飞;罗国良;王振军;易立;冯二凯;王春霞;赵宗正;陈明军;魏先力;高华;单晓枫;程悦宁

作者机构: 中国农业科学院特产研究所农业农村部经济动物疫病重点实验室;吉林农业大学动物科学技术学院;军事科学院军事兽医研究所;吉林省榆树市秀水镇畜牧站;通辽市科尔沁区动物疫病预防控制中心

关键词: 水貂犬瘟热病毒;微滴数字PCR;N基因

期刊名称: 中国兽医学报

ISSN: 1005-4545

年卷期: 2023 年 43 卷 012 期

页码: 2445-2450

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立检测水貂犬瘟热病毒(mink canine distemper virus,CDV)的微滴数字 PCR(droplet digital PCR,ddPCR)定量方法,以便提供水貂CDV在诊断检测方面的技术支持,本研究根据实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)检测方法原理,建立了水貂CDV数字PCR方法,并优化了反应条件,评估了特异性、敏感性以及重复性.结果表明:ddPCR方法检测CDV的最适引物浓度为900 nmol/L,探针浓度为250 nmol/L,退火温度为55℃,升降温度为2.5℃/s,最低检测下限为4.4拷贝/μL;除CDV特异性扩增,其他常见病毒特异性检测结果均为阴性;重复性试验的变异系数均小于5%.采用该微滴数字PCR和荧光定量RT-PCR方法对30份犬、貂、狐、貉等组织(其中CDV阳性样品7份)样品进行检测,检测结果与临床检测结果相符.本研究建立的微滴数字PCR方法对CDV定量检测特异性强、灵敏度高,重复性好,可以用于水貂CDV临床样品的核酸检测,对水貂CDV发病早期的诊断提供新的定量检测方法.

分类号: S852.65

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