鸭坦布苏病毒贵州株分离鉴定及其E基因生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 徐景峨
作者: 徐景峨;胡成云;陈汝佳;李婷;张亚楠;余波;张雨梅;李林林
作者机构:
关键词: 坦布苏病毒;培养特性;E基因;克隆;生物信息学分析
期刊名称: 扬州大学学报(农业与生命科学版)
ISSN: 1671-4652
年卷期: 2023 年 002 期
页码: 10-18
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 从贵州三穗县某鸭场的病鸭病料中分离出1株坦布苏病毒(tembusu virus, TMUV),经鉴定将其命名为TMUV-GZ。为了解该分离株的生物学特性及其E基因的分子特点,测定TMUV-GZ株的半数胚致死量(ELD50),将病毒接种至不同宿主细胞,观察其适应性与增殖能力;对E基因克隆测序并进行序列分析,对其编码的蛋白质进行生物信息学分析。结果表明:TMUV-GZ株能导致鸡胚和鸭胚死亡,该分离株无血凝性,在鸭胚上的ELD50为10-2.63·(0.2 mL)-1;该分离株能在Vero细胞、BHK-21细胞和DF-1细胞上增殖,对BHK-21细胞适应性最好。该分离株的E基因与泰国分离株DK/TH/CU-99核苷酸同源性最高,为98.3%;一级结构预测E蛋白的理论等电点为5.01,不稳定系数为39.5,为稳定蛋白质;二级结构预测该蛋白质以α-螺旋、β-折叠、β-转角较多,为亲水性蛋白质,可能存在10个优势抗原表位、2个跨膜区、3个结构域,无信号肽;三级结构预测该蛋白质模型结构与其他黄病毒E蛋白实验结构之间具有良好的一致性。综上,这一研究为TMUV亚单位疫苗和基因工程疫苗的研制提供了理论依据。
分类号: S852.65
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