苦荞Ft4CL基因克隆、生物信息学及分子进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 侯思宇

作者： 侯思宇;赵盖超;刘荣华;孙朝霞;令狐斌;韩渊怀;许冬梅;李红英

作者机构：

关键词： 苦荞;4-香豆酸辅酶A连接酶;电子克隆;生物信息学分析

期刊名称： 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-8151

年卷期： 2015 年 01 期

页码： 411-415

摘要： 与其他作物相比,苦荞中含有较高含量的黄酮类物质-‘芦丁’。4-香豆酸-辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,EC 6.2.1.12)是植物苯丙烷代谢途径转向黄酮类物质代谢的关键酶之一。本研究利用已知的来源于‘九江苦荞’叶片的Ft4CL1(HQ654088)基因片段为探针序列,从苦荞叶片转录组数据库中序列拼接得到一个苦荞Ft4CL全长基因,命名为Ft4CL(GenBank登录号:KM362863)。生物信息学分析结果表明:该cDNA长度为2 007bp,具有完整的ORF,共1 743bp,编码580个氨基酸,具备4CL所有活性位点。与已公布的部分Ft4CL基因及蒺藜苜蓿(Pb4CL)、甜瓜(Cm4CL)和黄瓜(Cs4CL)基因相似度为100%、73%、73%和72%。遗传聚类结果显示,该基因归类于双子叶植物。研究结果为深入探讨苦荞黄酮代谢途径提供了基础,也为提高苦荞黄酮含量提供了定向靶基因。

分类号： Q943.2

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