松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区序列特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘畅

作者： 刘畅;王大力;白文林;张金玉;张树敏;赵志辉

作者机构：

关键词： 松辽黑猪;IGF-Ⅰ基因;克隆;启动子

期刊名称： 吉林农业大学学报

ISSN： 1000-5684

年卷期： 2009 年 31 卷 02 期

页码： 94-99

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对松辽黑猪类胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)基因5′调控区进行了T-A克隆和序列测定,在分析序列结构特征的基础上与GenBank中野猪、大白猪、牛、山羊、绵羊进行了比较基因组学和系统进化研究。结果表明:松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区存在C/EBPb、MATal、Oct-1、CF-1等多个潜在的转录因子结合位点,可能与IGF-Ⅰ的转录调控和起始以及特异表达有关。在该非编码序列中,重复序列所占比率为2.22%,不存在SINEs、LINEs、LTR类反转录元件和DNA转座子元件,而发现存在1个(CA)18微卫星位点。在松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区,松辽黑猪与野猪、大白猪、牛、山羊、绵羊各物种间同源性大小分别为99.0%、98.8%、90.7%、91.6%、90.6%。MUPD法构建的分子系统进化树聚类结果表明,野猪与大白猪先聚为一类,再与松辽黑猪聚类形成一个大分支,而山羊和绵羊先聚成一类,再与牛聚类形成一个大分支,然后再与猪的一支汇合在一起。

分类号： S828

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