小鹅瘟病毒GPV-YG株主要开放性阅读框架核苷酸序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 葛艳

作者： 葛艳;尤永进;徐泉兴;陈谊;饶忠

作者机构：

关键词： 小鹅瘟病毒;开放性阅读框架;核苷酸序列

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2005 年 21 卷 02 期

页码： 11-15

收录情况： CSCD

摘要： 通过PCR技术分段扩增小鹅瘟病毒(Gooseparvovirus,GPV)扬州分离株GPV YG的2个主要开放性阅读框架(openreadingframe,ORF)基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,其结果在GenBank登录。将上述序列与登录的国外参考株GPV-B株作比较,GPV-YG主要ORF核苷酸序列与GPV-B的同源性为94%,显示二者亲缘关系密切。在此基础上,分别确定了GPV-YG编码结构蛋白和非结构蛋白的基因组序列,并推导出GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的相应的氨基酸序列,GPV-YG与GPV B结构蛋白的氨基酸序列同源性为96.4%,非结构蛋白同源性为97.9%,由此进一步分析了GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的氨基酸序列与功能特征。同时,将GPV-YG主要ORF与番鸭细小病毒(MuscovyDuckParvovirus,MDPV)FM作比较,核苷酸序列同源性为80%,非结构蛋白推导氨基酸序列同源性为89.6%,结构蛋白为84.6%。

分类号： S852.65

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