大豆BAC克隆基因注释

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王囡囡

作者： 王囡囡

作者机构：

关键词： 大豆BAC克隆;序列比对;基因注释

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2010 年 0 卷 12 期

页码： 110-112+117

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据来源于大豆BAC克隆库中的基因组序列,与其比对的基因或蛋白质序列可以从一些数据库中搜索,如GenBank序列数据库、EMBL数据库、PDB数据库等,然后利用NCBI的Entrz程序在数据库中搜索大豆基因类似物,获取其登录号及核苷酸序列,以及这些基因编码的氨基酸序列,通过GENSCAN等软件分析,得出的是与拟南芥等物种序列比对的结果,根据GENSCAN的预测结果,可以初步得知序列长度、基因数目及具有编码某种功能蛋白的基因存在的可能性,进而对预测出的氨基酸或核苷酸序列利用数据库NCBI中的BLAST进行序列的相似性搜索及比对分析,寻找其保守区域。最后对其功能基因进行注释。

分类号： S565.1

  • 相关文献

[1]基于高通量测序的杂交鳢转录组数据分析. 黄勇,龚望宝,陈海刚,孙西红. 2019

[2]棉花产量相关性状QTL定位及候选基因筛选. 贾晓昀,朱继杰,赵红霞,王士杰,李妙,王国印. 2021

[3]木贼镰孢基因功能注释及比较基因组学分析. 李雪萍,许世洋,范雨轩,汪学苗,张怡忻,李敏权. 2021

[4]大蜡螟触角转录组及嗅觉相关基因分析. 杨爽,赵慧婷,徐凯,郭丽娜,杜亚丽,李新宇,苏文婷,冯宇佳,龙登隆,姜玉锁. 2019

[5]基于RNA-Seq高通量测序技术的大口黑鲈转录组分析. 黄勇,龚望宝,陈海刚,熊建利,孙西红. 2019

[6]巴哈雀稗幼苗叶片转录组分析. 张宇君,尚以顺,王普昶,赵丽丽,熊先勤,张文,丁磊磊,柳嘉佳. 2019

[7]肇实转录组测序及生物信息学分析 被引量:1. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019

[8]肇实转录组测序及生物信息学分析. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019

[9]梨网蝽触角嗅觉相关基因分析. 王宏民,董田,郑海霞,白鹏华,刘宝生,张仙红. 2021

[10]基于RNA-seq的能源植物芒转录组分析. 张贤,王建红,喻曼,曹凯,庄俐,徐昌旭,曹卫东. 2015

[11]从公共数据库中利用数据挖掘的方法开发15条黄金鲈EST-SSR标记（英文）. 王丹,姚红,王卫民,邹桂伟,王汉平. 2018

[12]基于高通量测序的海滨雀稗转录组学研究. 贾新平,叶晓青,梁丽建,邓衍明,孙晓波,佘建明. 2014

[13]绿眼赛茧蜂转录组分析及嗅觉相关蛋白基因的鉴定. 王予彤,徐林波,段立清,于良斌,崔进,曹媛媛,赵一安. 2021

[14]绿豆象触角转录组及嗅觉相关基因的分析. 郑海霞,张耀文,张仙红,杨美红. 2018

[15]奶牛瘤胃微生物BAC文库中ACCase基因的筛选与生物信息学分析. 赵圣国,王加启,卜登攀,刘开朗,朱雅新,周凌云. 2011

[16]彩色马蹄莲转录组测序及其特性分析. 周琳,张永春,蔡友铭,杨柳燕. 2020

[17]基于高密度SNP标记的肉牛人工选择痕迹筛查. 刘喜冬,王志鹏,樊惠中,李俊雅,高会江. 2012

[18]基于RNA-Seq的雌蕊缺失茶树花转录组分析. 夏丽飞,陈林波,李梅,宋维希,田易萍. 2017

[19]基于PacBio三代测序的香瓜茄(人参果)基因组的组装. 司诚,钟启文,杨世鹏. 2022

[20]陆地棉低世代群体纤维品质QTL定位及候选基因功能注释. 乔文青,严根土,石建斌,王宁,张亚林,许庆华,周红,黄群. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序