梨遗传连锁图谱的构建与比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王磊

作者： 王磊;王龙;薛华柏;李秀根;李疆

作者机构：

关键词： 梨;SSR;连锁图谱;整合图谱

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2016 年 49 卷 12 期

页码： 2353-2367

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】利用已公开发表的梨和苹果的SSR(Simple Sequence Repeat)引物以及从梨转录组开发的SSR引物构建本研究作图群体的遗传连锁图谱,为后期梨重要性状QTL定位和分子标记辅助选择等奠定基础。【方法】以西洋梨品种‘红茄’(Red Clapp Favorite)为母本,东方梨品种‘晚秀’(Mansoo)为父本,构建F1代作图群体。将所选用的SSR引物在亲本和4个子代个体进行PCR扩增,初步筛选出扩增结果符合Join Map 4.0软件中"CP"作图模式要求的引物,随后在F1群体中检测,选用Join Map 4.0软件对分离数据进行连锁分析,分别构建亲本的连锁图谱。以双亲图谱在各连锁群上的同源标记作为锚定位点,对双亲图谱进行整合。【结果】利用PCR技术对不同来源的共909对SSR引物(526对梨和283对苹果公开发表的SSR引物,从梨转录组开发的100对SSR引物)进行初步筛选后,发现来自苹果的SSR引物有效扩增片段的比例和多态性均较低,而来自梨和梨转录组开发的SSR引物相对较高。筛选出207对符合作图要求的SSR引物在群体中扩增,构建亲本的连锁图谱。母本图谱中的141个标记分布在17个连锁群上,总长度757.34 c M,标记间平均5.37 c M;父本图谱中的153个标记分布在19个连锁群上,总长度1 149.43 c M,标记间平均7.51 c M。【结论】对不同来源的SSR引物构建的双亲连锁图谱进行整合,最终得到一张由186个SSR标记,覆盖基因组长度1 125.33 c M的整合图谱。

分类号： S661.2

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