大型奶牛养殖环境源大肠埃希菌毒力基因与系统进化分群
文献类型: 中文期刊
第一作者: 唐敏嘉
作者: 唐敏嘉;张雪婧;何卓琳;蒲万霞
作者机构: 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所农业农村部兽用药物创制重点实验室/甘肃省新兽药工程重点实验室
关键词: 大肠埃希菌;奶牛养殖环境;毒力基因;系统进化分群
期刊名称: 中国兽医学报
ISSN: 1005-4545
年卷期: 2022 年 42 卷 008 期
页码: 1612-1619
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 对甘肃2个大型奶牛养殖环境的大肠埃希菌(Escherichiacoli,E.coli)分离株进行系统进化分群和毒力基因分布情况研究,分析系统群与E.coli主要毒力基因之间的潜在关联,以期为E.coli的研究和防治提供参考.利用PCR方法对281株E.coli分离株进行系统进化分群鉴定和毒力基因检测.281株E.coli分离株被分为8个系统进化群,B1、A、E、F、D、C、B2 群和隐支 Ⅰ 或 Ⅱ 的占比分别为 51.96%,28.47%,11.39%,2.85%,1.78%,1.07%,0.71%,0.36%,有4株为未知系统群.毒力基因检测结果显示,ompA、ibeB、ompT、iroN、traT、iucD、fyuA和irp2的阳性率分别为100%,98.58%,76.16%,71.53%,68.33%,64.06%,30.96%,30.25%.不同年份和养殖环境的部分毒力基因的分布存在明显差异,携带8个所鉴定的毒力基因的菌株在B1、B2群和粪土源中的分布较多;traT在2017年的分布明显低于2018和2019年;traT和iroN在粪土源分离株中的分布高于污水源.系统群与毒力基因的关联性分析结果显示,A群与ompT和traT存在负相关性;B1群与ompT、irp2、fyuA和iucD存在正相关性;E群与 irp2、fyuA和iucD存在负相关性,与iroN存在正相关性.系统进化分群以B1群为主,不同年份和养殖环境的部分毒力基因的分布有明显的差异;部分毒力基因的分布与系统群存在联系.
分类号: S852.61%R535
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