利用BSA-Seq方法定位一个水稻早衰相关基因OsBRCA1

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蒋家焕

作者： 蒋家焕;朱永生;陈丽萍;郑燕梅;蔡秋华;谢华安;王爱荣;张建福

作者机构：

关键词： 水稻;突变体;早衰;基因克隆;BSA-seq

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2022 年 37 卷 002 期

页码： 131-137

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]水稻早衰突变体是研究水稻衰老机制的良好载体.定位和克隆水稻早衰相关基因,有助于理解水稻早衰的遗传规律和分子机制,为相关基因的作用机制研究奠定基础.[方法]用EMS化学诱变处理粳稻云引,获得一个稳定遗传的早衰突变体w14,与日本晴杂交构建F2分离群体,并在群体中各选择100个隐性单株和显性单株的DNA等量混合,利用BSA-seq分析两个DNA池之间的差异位点,定位水稻早衰相关基因.[结果]突变体w14的早衰表型受单隐性基因控制,对两个DNA池测序结果进行单基因定位和突变基因的鉴定,发现单基因主峰位于Chr3,候选区间为Chr3:27.5~29.5 Mb,进一步在目标区域内找到2个符合条件的候选因果变异.[结论]候选基因LOC_Os03g49210突变位点是由野生型的C突变为T,且该突变位于候选基因的第2外显子上,属于错义突变,造成了该基因编码的第20个氨基酸由T(苏氨酸)变成I(异亮氨酸),从而可能导致了基因功能的改变,因此,将该基因定为本研究的候选基因,因与人类BRCA1同源,命名为OsBRCA1.

分类号： S511

  • 相关文献
作者其他论文 更多>>

微信小程序