香蕉穿孔线虫β—1,4-内切葡聚糖酶基因的克隆与特征分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 肖罗

作者: 肖罗;陈国华;戴良英;吕春花;杨宇红;谢丙炎

作者机构:

关键词: 香蕉穿孔线虫;香蕉;β-1,4-内切葡聚糖酶;GHF5家族;原位杂交

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2008 年 35 卷 10 期

页码: 1431-1440

收录情况: CSCD

摘要: 植物寄生线虫的分泌物在线虫的侵染过程中具有重要的作用,其中纤维素水解酶是研究较多的主要分泌物之一。采用RT—PCR和RACE方法,从香蕉穿孔线虫(Radopholus similis)中获得编码β-1,4-内切葡聚糖酶基因的eDNA序列,命名为RS—eng—1(GenBank登录号为EU414839)。该cDNA序列全长1630bp,包含一个1404bp的开放阅读框(ORF),编码含467个氨基酸的蛋白,理论分子量与等电点分别为48.22kD和6.04。序列分析表明该酶含有糖基水解酶家族5(GHF5)的保守结构域,N端具有22个氨基酸残基组成的信号肽,C端含有细菌式样的纤维素结合域(CBDⅡ)。原位杂交结果显示此基因在香蕉穿孔线虫的食道腺部位表达,并且Southern结果显示其为多拷贝基因。cDNA与基因组DNA重叠分析表明,此基因包含6个内含子,切割点符合5’-GT...AG-3’的规律。进化分析表明该酶与细菌Bacillus subtilis和Erwina carotovora分泌的纤维素酶属于同一支,推测其来源于细菌的水平基因转移。

分类号:

  • 相关文献

[1]香蕉穿孔线虫β-1;4-内切葡聚糖酶基因的克隆与特征分析. 肖罗,陈国华,戴良英,吕春花,杨宇红,谢丙炎. 2008

[2]香蕉穿孔线虫β-1,4-内切葡聚糖酶基因的克隆与特征分析. 肖罗,陈国华,戴良英,吕春花,杨宇红,谢丙炎. 2008

[3]南方根结线虫、香蕉穿孔线虫和尖孢镰刀菌4号生理小种对巴西蕉致病力的测定. 符美英,肖彤斌,吴凤芝,曾向萍,陈绵才. 2014

[4]5个香蕉穿孔线虫种群对香蕉的致病性测定. 符美英,吴凤芝,卜小莉,王会芳,陈绵才. 2011

[5]香蕉果实类受体蛋白激酶基因克隆及RNAi载体构建. 张建斌,刘菊华,贾彩红,金志强,徐碧玉. 2013

[6]香蕉类受体蛋白激酶基因的克隆及杂交鉴定(英文). 张建斌,金志强,刘菊华,贾彩红,赵丽丽,徐碧玉. 2012

[7]甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析. 彭德良,黄文坤. 2009

[8]甘薯茎线虫β-1;4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析. 彭德良,黄文坤. 2009

[9]香蕉穿孔线虫(Radopholus similis)特异性分子检测技术研究. 耿丽凤,张东升,彭德良. 2011

[10]香蕉穿孔线虫(Radopholussimilis)特异性分子检测技术研究. 耿丽凤,张东升,彭德良. 2011

[11]香蕉穿孔线虫28S rRNA基因的D2/D3区序列分析. 彭德良,黄文坤. 2008

[12]香蕉穿孔线虫28S rRNA基因的D2/D3区序列分析. 彭德良,黄文坤. 2008

[13]危险性外来入侵香蕉穿孔线虫在我国的适生性风险分析. 彭德良. 2008

[14]香蕉穿孔线虫28SrRNA基因的D2/D3区序列分析. 彭德良,黄文坤. 2008

[15]外来入侵线虫的分子检测技术研究进展. . 2007

[16]危害红掌的穿孔线虫形态和分子鉴定. 高月荣,陈昌龙,杨光穗,简恒,牛俊海. 2013

[17]罹病植物组织中香蕉穿孔线虫分子检测方法研究. 彭德良,张东升. 2010

[18]香蕉穿孔线虫种类及诊断研究进展. 李一农. 2005

[19]外来入侵香蕉穿孔线虫(Radopholussimilis)分子特征研究. 耿丽凤,于海英,李建中,彭德良,黄文坤. 2007

[20]潜在外来入侵香蕉穿孔线虫在我国的适生性风险分析. 彭德良. 2008

作者其他论文 更多>>