西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性及系统进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 海汀

作者： 海汀;柴志欣;张成福;信金伟;姬秋梅;曾贤彬;钟金城

作者机构：

关键词： 西藏牦牛;mtDNA ND6基因;遗传多样性;系统进化

期刊名称： 家畜生态学报

ISSN： 1673-1182

年卷期： 2014 年 35 卷 11 期

页码： 11-17

收录情况： 北大核心

摘要： 为从分子水平上探究西藏牦牛的序列多态性、遗传多态性及其系统进化关系,对西藏15个牦牛类群150个个体的mtDNA ND6基因全序列进行了测定,确定了多态位点和单倍型数目,计算了单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi),并构建了分子聚类关系图和单倍型系统发育树。结果表明:西藏牦牛mtDNA ND6基因全序列长度均为528bp,T、C、A和G 4种碱基的平均比例分别为42.2%、7.6%、20.9%、29.3%,存在一定的碱基组成偏倚性。序列变异中存在转换、颠换2种核苷酸变异类型,其中转换37次,颠换2次,表现出较强的转换偏倚性。根据序列间核苷酸变异共确定7种单倍型,其中Hap_1为西藏牦牛类群的主流单倍型,其余6种单倍型为部分类群所特有。平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.2978、0.00191,揭示西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性较贫乏。根据遗传距离构建了分子聚类关系图,表明西藏15个牦牛类群可分为2大类;根据7种单倍型序列构建了单倍型系统发育树,表明西藏牦牛存在2个母系起源。

分类号： S823.85

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