花生CC-NBS-LRR家族基因鉴定及在青枯病和网斑病胁迫下的表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 汪晓
作者: 汪晓;齐飞艳;孙子淇;郑峥;徐静;王娟;韩锁义;黄冰艳;董文召;张新友
作者机构:
关键词: 花生;CC-NBS-LRR;青枯病;网斑病;表达分析
期刊名称: 中国油料作物学报
ISSN: 1007-9084
年卷期: 2025 年 47 卷 002 期
页码: 344-355
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为明确花生基因组中CC-NBS-LRR(CNL)的家族成员及其功能,对其基因家族成员进行生物信息学分析和表达模式分析,研究花生如何响应病害胁迫。以花生基因组序列为参考,利用Pfam、HMMER、NCBI和CoiledCoil等软件和在线网站筛选,共鉴定得到85个AhCNL家族成员,分布在20条染色体中的15条上,以A02和A12染色体上分布最多,并且大多成簇存在于染色体末端;系统进化树分析表明其可分为4个亚族,每个亚族中的基因成员保守性较高;共线性分析表明在物种内有16对基因存在共线性关系,物种间分析表明相比于拟南芥和苜蓿,花生与大豆的CNL具有较高的同源性;启动子上含有大量与激素相关和抗病相关的顺式作用元件;大部分CNL家族基因在病菌入侵前后均不表达,少部分基因受到病菌诱导后表达量有变化。
分类号: S435.652
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