牛冠状病毒TaqMan荧光定量检测方法的建立及国内部分地区流行病学调查

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄金

作者： 黄金;李思远;谢玲玲;周迪;杨蓉;王松;周华;蔡旭航;李基棕;李彬

作者机构：

关键词： 牛冠状病毒;TaqMan荧光定量;样品检测;隐性感染;RT-PCR

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2023 年 017 期

页码： 29-33

收录情况： 北大核心

摘要： 牛冠状病毒（BCoV）在全球广泛存在，在临床上能引起牛腹泻以及呼吸道感染，给养殖业带来巨大经济损失。为快速批量检测临床样品、分析国内的BCoV隐性感染及流行情况，根据BCoV的N基因序列设计了引物和探针，建立了TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法，对其特异性、敏感性、重复性进行评估，并将其与靶向BCoV的N基因的常规RT-PCR方法进行对比。利用本方法对采集自我国西藏、江苏、河北、贵州、安徽等5个省份的22个未发病牛场的35份口腔拭子样品和244份粪便样品进行检测以了解流行情况。结果表明，质粒标准品拷贝数的对数与CT值呈现良好稳定的负线性关系，标准曲线为y=-3.441 8x+39.584 0,r~2=0.999 4,E=98.2%;最低检测拷贝数为6.0×10拷贝/μL,重复性变异系数均＜5%;对临床样品进行检测，检出率明显高于常规RT-PCR方法。对22个牛场的279份病料进行检测，结果显示BCoV的总体阳性率为73.12%,牛场阳性率为100.00%。本研究成功建立了靶向BCoV N基因、灵敏度高、特异性好的荧光定量RT-PCR检测方法，并初步掌握了我国5个省份BCoV的流行现状，为后续BCoV研究奠定了基础。

分类号： S852.65

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