‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 温世杰

作者： 温世杰;李杏瑜;洪彦彬;李少雄;周桂元;陈小平;梁炫强

作者机构：

关键词： 花生;脂肪酸脱氢酶;生物信息学;油料作物

期刊名称： 热带农业科学

ISSN： 1009-2196

年卷期： 2017 年 09 期

页码： 38-44

摘要： 植物中的Δ12脂肪酸脱氢酶(FAD2)是油酸形成亚油酸的关键酶。通过NCBI和EXPASY 2大数据库,采用Signal P、TMHMM、Psort、Prot Param和Target P等分析程序对花生品种‘航花2号’及其它物种的19个FAD2蛋白序列进行分析,利用MEGA6.0软件比对序列及构建系统进化树阐明FAD2基因的系统发育关系,亲缘相近的FAD2蛋白聚在一起。预测了‘航花2号’和‘粤油13’的FAD2蛋白的分子质量、等电点、信号肽、跨膜和保守结构域等。结果表明:‘航花2号’FAD2蛋白的N端没有信号肽,预测定位在微体、细胞质、线粒体基质和叶绿体类囊膜中,而C端信号基序LKGL使得FAD2蛋白选择性地结合和嵌入内质网,植物的FAD2蛋白普遍有3个高度保守的组氨酸富集基序(HECGHH、HRRHH和H[A/C/T]HH)和3~5个跨膜结构,但分析结果显示,‘航花2号’的FAD2蛋白的H[A/C/T]HH的组氨酸基序是缺失的,而油酸转化为亚油酸的效率上并没有显著变化,为将来FAD2基因的基因工程操作提供一定的理论基础。

分类号： Q811.4`S565.2

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