基于高通量测序的大麦InDel标记开发及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐婷婷

作者： 徐婷婷;汪巧玲;邹淑琼;狄佳春;杨欣;朱银;赵涵;颜伟

作者机构：

关键词： 大麦;重测序;InDel标记;品种鉴定

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2020 年 46 卷 009 期

页码： 1340-1350

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 分子标记是遗传研究的基础工具,广泛应用于遗传多样性研究、种质鉴定、遗传图谱构建和基因定位等领域.本研究基于大麦的全基因组重测序数据鉴定出的二态性SNP位点,开发出遍布全基因组的118对InDel引物.以49份不同地理来源的大麦种质检测其有效性,筛选出2个等位基因的共显性InDel标记72对,进一步对288份大麦种质进行遗传距离分析及构建系统发育树.结果显示,筛选到32个有效性的核心InDel标记,覆盖大麦7条染色体上,平均PIC为0.44,平均MAF为0.34;基于InDel标记位点的供试大麦的系统发育树结果揭示供试大麦具有丰富的遗传多样性,且能够将具有相同地理来源的多数品种聚为一类.表明开发的32个二态性InDel标记可有效地用于鉴定品种间的亲缘关系,且丰富了大麦品种鉴定的分子标记.上述核心InDel标记在大麦品种鉴定、大麦资源亲缘关系分析以及群体划分方面具有一定的理论意义和应用价值.

分类号：

  • 相关文献

[1]基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用. 陆海燕,陈璐,王显生,赵涵,沈奇. 2019

[2]基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用. 陆海燕,陈璐,王显生,赵涵,沈奇. 2019

[3]基于重测序番茄InDel标记的开发. 张国儒,唐亚萍,杨涛,帕提古丽,王柏柯,李宁,王娟,李晓琴,余庆辉,杨生保. 2019

[4]基于重测序的芥蓝(Brassica alboglabra)全基因组InDel标记开发. 洪晓如,吴智明,陈汉才,黎庭耀,沈卓,张艳. 2021

[5]利用InDel标记分析中国香菇菌株的遗传多样性与群体结构. 沈秀芬,章炉军,张美彦,张丹,于海龙,李玉. 2021

[6]基于黄瓜基因组重测序的InDel标记开发及其应用. 李斯更,沈镝,刘博,邱杨,张晓辉,张忠华,王海平,李锡香. 2013

[7]利用InDel标记鉴定花椰菜'津品70'种子真实性与纯度. 王梦梦,杨迎霞,谢添羽,陈锐,吕明杰,张冠,王倩,谭津,姚星伟. 2022

[8]利用InDel标记鉴定花椰菜‘津品70’种子真实性与纯度. 王梦梦,杨迎霞,谢添羽,陈锐,吕明杰,张冠,王倩,谭津,姚星伟. 2022

[9]基于重测序的'金兰柚'基因组InDel标记的开发及应用. 汤雨晴,杨惠栋,闫承璞,王斯妤,王雨亭,胡钟东,朱方红. 2023

[10]基于辣椒基因组重测序的InDel标记开发及应用. 郭广君,孙茜,刘金兵,潘宝贵,刁卫平,戈伟,高长洲,王述彬. 2015

[11]基于重测序的菠萝基因组InDel标记的开发. 贺涵,刘传和,喻梦凡,袁梦萍,魏岳荣,杨敏,邝瑞彬,周陈平,吴夏明,徐泽. 2025

[12]基于基因组重测序技术开发特定地区黄鳝品系InDel标记. 李目岩,赵一帆,黄伟伟,袁泉,杨航,张禹宁,李名友,吕巍巍,周文宗. 2025

[13]性状鉴别联合InDel标记检测快速鉴定柑桔品种. 刘小丰,王洪,刘梦雨,朱世平,江东,曹立,余歆. 2024

[14]基于高通量芯片的大麦高效KASP标记的开发和应用. 徐婷婷,孟珊,朱小品,邹淑琼,狄佳春,杨欣,朱银,郭春滨,颜伟. 2024

[15]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[16]利用混池重测序鉴定萨福克绵羊超数排卵关键调控基因. 滑留帅,辛晓玲,王璟,罗生金,曾滔,巴提玛,施巧婷,徐照学,王二耀. 2019

[17]利用重测序染色体片段代换系群体定位水稻籽粒长宽比QTL. 卫纯洁,陶亚军,范方军,李文奇,王芳权,许扬,陈智慧,仲维功,杨杰,王军. 2020

[18]不同光周期条件下谷子株高的全基因组关联分析. 贾小平,张博,全建章,李剑峰,王永芳,袁玺垒. 2019

[19]利用重测序技术开发高粱多态性SSR分子标记. 王平,王春语,张丽霞,丛玲,朱振兴,陆晓春. 2019

[20]全基因组选择技术在反刍动物遗传育种中的研究进展及其应用. 张顺进,寇浩玮,丁晓婷,刘贤,蔡雯雯,张子敬,施巧婷,茹宝瑞,雷初朝,黄永震. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序