珍稀濒危树种毛红椿微卫星DNA分离及SSR反应体系优化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘军

作者： 刘军;孙宗修;陈益泰;何贵平;吴天林

作者机构：

关键词： 毛红椿;微卫星;链亲和素磁珠;SSR反应体系

期刊名称： 中国生物工程杂志

ISSN： 1671-8135

年卷期： 2006 年 26 卷 12 期

页码： 50-55

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以江西宜丰种源毛红椿为材料,成功提取其基因组DNA。利用改良的链亲和素磁珠法亲和捕捉出毛红椿基因组微卫星DNA片段,并构建了富含微卫星的基因组文库。从构建的基因组文库中随机挑选了63个单克隆进行测序,其中50个单克隆成功测序,含有微卫星的单克隆有18个,并根据测序结果设计并合成SSR引物18对。利用所合成的引物优化SSR反应体系,对影响SSR反应的各个因子进行了探讨。确定了模板DNA最适浓度为30ng;dNTP的最适浓度为0.3mmol/L;0.3μmol/L是引物在反应体系中的最合适浓度。建立了重复性好、稳定性好的SSR反应体系,为下一步进行毛红椿群体遗传结构和遗传变异研究提供了技术支持。

分类号： S792.99

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