基于重测序的印度南瓜种质资源遗传多样性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘静
作者: 刘静;徐玉婷;黄钰;曾庆国;丁兰;黄伟忠;王尖;许小江
作者机构:
关键词: 印度南瓜;基因组重测序;变异位点;系统发育树
期刊名称: 中国蔬菜
ISSN: 1000-6346
年卷期: 2025 年 010 期
页码: 88-94
收录情况: 北大核心
摘要: 南瓜是重要的蔬菜作物之一,具有较高的营养价值与经济价值。为研究印度南瓜商品种的遗传多样性,以52份印度南瓜材料为研究对象,采用二代测序的方法进行基因组重测序,对测序数据过滤后鉴定变异位点,并进行系统发育分析。结果表明:52份印度南瓜材料具有丰富的遗传多样性,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和插入缺失标记(insertion-deletion,InDel)位点具有区域集中性,并且两种变异位点在染色体上的分布具有差异性。系统发育分析将52份印度南瓜材料分为7大类,分别包括2、10、1、5、11、7、16份种质,其中第1类群仅有品种锦栗2号和霍比特,第3类群仅有品种俊荣,与其他商品种有较大的遗传差异。研究结果为印度南瓜品种保护和遗传改良提供了丰富的信息。
分类号: S642.1
- 相关文献
[1]瑶山鸡TRHR基因编码区序列SNP检测及其与繁殖性状的相关性. 伍革民,徐龙鑫,朱丽莉,唐继高. 2017
[2]7种金鱼线粒体基因组比较. 赵莹莹,郑先虎,匡友谊,马立鸣,何川,朱晓琛,董婧,魏华,孙效文. 2018
[3]不同产地瓠瓜品种ITS序列的遗传多样性分析. 赵芹,谢大森,彭庆务,罗少波,郭巨先,邓沙沙. 2014
[4]原产地与入侵地椰子织蛾遗传分化特征. 杨帆,李优佳,SHAMEER K S,阎伟,吕宝乾,蒋方一丁,章雨璐,涂艳,齐可欣. 2021
[5]利用线粒体DNA COI基因对滩羊种属鉴别的研究. 马青,李颖康,马丽娜. 2015
[6]藜属植物叶绿体基因组结构与系统进化. 蒋礼玲,王琳超,黄新荣,杨宇若,王明雪,贾举庆,黄胜雄. 2022
[7]宁夏滩羊mtDNA Cyt b基因遗传多样性分析. 马丽娜,马青,李颖康. 2014
[8]加工番茄Ve-1、I-2、Mi-1和Pto基因关联变异位点的挖掘. 刘磊,邓学斌,冯晶晶,王静,孙晓荣,舒金帅,李君明. 2018
[9]甘蔗HTD2基因的表达特征及基因多态性分析. 李旭娟,李纯佳,吴转娣,田春艳,胡鑫,丘立杭,吴建明,刘新龙. 2022
[10]利用水稻耐盐品种Pokkali衍生材料选育的高产耐盐新种质的遗传变异. 刘春蕾,王娟. 2025
[11]榴莲99份种质资源变异位点数据集. 冀晓昊,郑道君,谢圣华,时梦,钟义旺,王莹莹,王孝娣,刘凤之,冯学杰,王海波. 2025
[12]基于名优谷子品种晋谷21全基因组重测序的分子标记开发. 赵庆英,张瑞娟,王瑞良,高建华,韩渊怀,杨致荣,王兴春. 2018
[13]锦鲤基因组数据分析及体色相关基因的筛选. 史东杰,胡金有,朱华,张欣,李荣妮,孙砚胜. 2019
[14]基于基因组重测序信息构建玉米第5染色体的片段代换系. 林峰,葛敏,宝华宾,赵涵. 2015
[15]13个杂交水稻亲本产量性状基因等位变异. 蒋平,胡运高,高方远,吕建群,刘松,郭鸿鸣,刘利平,任国胜,苏相文,任明鑫,任光俊,任鄄胜. 2024
[16]基于重测序的槟榔InDel标记开发及应用. 齐兰,杨耀东,黄丽云,杨玉娟,尹永梅. 2024
[17]基于基因组重测序的高含量油酸转基因大豆T-DNA旁侧序列分析及事件特异性PCR检测. 仲晓芳,杨静,贺红利,牛陆,邢国杰,杨向东. 2018
[18]东乡野生稻与日本晴多态性标记的开发. 马小定,唐江红,张佳妮,崔迪,李慧,黎毛毛,韩龙植. 2019
[19]基于基因组重测序的长江上游瓦氏黄颡鱼群体遗传结构. 熊飞,刘红艳,翟东东,段辛斌,田辉伍,陈大庆. 2023
[20]希尔斯山羊草1SsS和3SsS染色体特异dCAPS标记的建立. 倪佳俊,韩冉,徐文竞,王开,祁广,曾小雪,訾妍,李豪圣,刘建军,汪晓璐,刘成. 2023
作者其他论文 更多>>
-
2004-2022年徐州地区气候因子及小麦区域试验品系性状演变分析
作者:刘立伟;刘静;王静;易媛;朱雪成;张娜;张会云;马红勃;刘东涛;冯国华
关键词:小麦;淮北地区;气候;区域试验;农艺性状;演变
-
长期条状施肥下成龄密植库尔勒香梨根系和土壤性状的空间关系
作者:邓永辉;兖攀;安世杰;陈奇凌;郑强卿;马凌;王振东;王国栋;刘静;王欣
关键词:库尔勒香梨;密植;树龄;根系;土壤养分;空间分布;条状施肥;土壤物理性质
-
克林巴马克葡萄在石河子地区的引种表现和设施一年两收栽培技术
作者:刘静;费青青;李志强
关键词:克林巴马克葡萄;设施栽培;一年两收
-
长江中下游夏季小白菜优质高效生产技术
作者:陈龙正;吕珍璐;刘静;刘之洋;宁宇;徐海
关键词:小白菜;湿热地区;夏季;生产关键技术
-
基于萌发期和苗期主要形态指标的耐旱小麦种质筛选与评价
作者:黄钰;翁雪莲;Indrila Dey Traye;王康君;周桂生;朱广龙;郭小倩;徐云姬
关键词:小麦;萌发期;幼苗期;耐旱性;筛选;干旱胁迫;形态指标
-
瓠瓜EMS诱变突变体筛选与表型分析
作者:郑程;汪颖;王尖;郭笑;汪宝根;吴新义;祝彪;李国景;吴晓花
关键词:瓠瓜;甲基磺酸乙酯;突变体;叶色黄化
-
观食两用紫红色小白菜品种比较试验
作者:刘静;周园园;陈颖;徐海
关键词:紫红色小白菜;品种比较试验;产量;花青素
