甘蔗叶绿体DNA的提取方法及其验证分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 岑华飞

作者： 黄玉新;罗霆;周珊;高轶静;段维兴;杨翠芳;周会;张革民

作者机构：

关键词： 甘蔗;叶绿体DNA;提取;trnL基因;改良的DNase I差速离心法

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2014 年 45 卷 04 期

页码： 26-30

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】探索适于普通实验室条件的甘蔗叶绿体DNA(cpDNA)提取方法,为甘蔗叶绿体分子生物学研究提供参考。【方法】参考水稻、小麦等作物cpDNA的DNase I差速离心处理法,采用改良的DNase I差速离心法提纯甘蔗cpDNA,并对其trnL基因序列进行比对分析,证实所提取cpDNA的可行性。【结果】采用改良的DNase I差速离心处理法提取能得到量多、杂质少的cpDNA,用Eppendorf蛋白核酸测定仪检测,平均每克甘蔗样可提取2.71μg cpDNA,OD260/OD280为1.79~1.90。对提取的cpDNA的trnL基因序列进行比对分析,证实参试的甘蔗栽培种、斑割复合体后代及其回交材料的叶绿体trnL基因与已报道的甘蔗栽培种NCo 310、SP-80-3280和割手密HN0046的trnL基因相似度均在99.0%以上,并在381、386、389、392、393、400、488、490 bp等8个位点上检测出碱基突变、插入和缺失现象。【结论】采用改良的DNase I差速离心处理法提取甘蔗叶绿体DNA具有可行性,提取的甘蔗cpDNA完全可以用于后续的分子水平研究。

分类号： S566.1

  • 相关文献

[1]苎麻叶绿体DNA的提取及分析. 郑建树,喻春明,陈平,王延周,谭龙涛,卢凌霄,陈继康,朱涛涛,熊和平. 2013

[2]香蕉叶绿体分离及叶绿体DNA提取方法. 龙兴,曾继吾,黄秉智,黄永红,易干军,陈金印,夏瑞. 2008

[3]甘蔗基因组RNA提取方法的研究. 胡军瑜,王俊刚,蔡文伟,张树珍,李晓君. 2009

[4]高质量甘蔗基因组DNA的简便快速提取方法研究. 覃肖良,廖青,高轶静,方锋学. 2010

[5]桃叶绿体全序列微卫星分布规律研究. 魏潇,章秋平,刘威生,杨巍. 2013

[6]分子生物技术在确定物种迁移后遗传变异中的应用. 沈禹颖,侯扶江. 2002

[7]茶树叶绿体DNA提取方法研究. 陈春梅,陈亮. 2014

[8]中国栽培稻及其近缘野生种叶绿体DNA的限制性片段长度. 肖晗,应存山,黄大年. 1996

[9]雷蒙德氏棉叶绿体基因组Fosmid文库构建. 李朋波,薛龙飞,王彦霞,张曦,李召虎,华金平. 2011

[10]苜蓿组培中叶绿体DNA和线粒体DNA的变异. 何启谦,刘新芝. 1994

[11]江淮流域杂草稻叶绿体DNA的籼粳分化. 杨杰,王军,曹卿,陈志德,汤陵华,王艳萍,方先文,王才林,仲维功. 2009

[12]基于叶绿体DNA变异的山荆子种质遗传多样性和系统演化. 高源,王大江,王昆,丛佩华,张彩霞,李连文,朴继成. 2020

[13]一种改良的水稻细胞质基因组制备方法. 万雯婷,董扬,于洋,李丽娟,张静. 2011

[14]非AA型野生稻叶绿体DNA籼粳特性研究. 邓华凤,陈良碧,何强,舒服,陈觉梁,袁隆平. 2007

[15]基于叶绿体DNA变异的湖北梨属种质系统进化及遗传多样性分析. 张靖国,曹玉芬,陈启亮,杨晓平,范净,田瑞,胡红菊. 2016

[16]基于叶绿体DNA 序列的Ceratotropis 亚属遗传进化研究. 刘岩,程须珍,王丽侠,王素华,白鹏. 2013

[17]植物细胞质雄性不育分子机理研究进展. 巩养仓,邢朝柱. 2006

[18]高粱细胞质雄性不育的分子遗传研究进展. 仪治本,梁小红,赵威军. 2005

[19]从叶绿体DNA角度分析云南省砂梨地方品种遗传多样性. 齐丹,曹玉芬,田路明,董星光,张莹,霍宏亮,常耀军. 2016

[20]基于叶绿体DNA分析的辽宁省梨属种质遗传多样性研究. 常耀军,曹玉芬,张金梅,田路明,董星光,张莹,齐丹,郑迎春. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序