基于Smart-seq2挖掘猪早期胚胎pDUXC类基因及其潜在功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 付博

作者： 付博;马红;汪亮;郭镇华;王芳;霍秀鹏;刘娣

作者机构：

关键词： 猪;pDUXC类基因;胚胎;转录本组装;Smart-seq2

期刊名称： 黑龙江动物繁殖

ISSN： 1005-2739

年卷期： 2025 年 33 卷 005 期

页码： 45-50

摘要： 研究旨在挖掘猪早期胚胎发育中 pDUXC 类基因及其潜在的功能.采用 Smart-seq2 单胚胎转录组测序与 StringTie 组装方法,对 4-细胞期猪体外受精胚胎进行系统分析,在 17 号染色体末端成功识别出DUX 类基因 pDUXC.通过生物信息学手段对 pDUXC 蛋白进行结构与功能预测.结果显示:pDUXC 蛋白含有两个保守的 HOX 同源域和富含脯氨酸的转录激活区,并具有明显的核定位信号,符合转录因子的典型特征.系统发育分析表明,pDUXC 与人类 DUX4 聚为一支,提示二者在进化上具有高度保守性.综合分析结果推测,pDUXC 可能通过激活 ERVs 参与合子基因组激活(ZGA),进而驱动早期胚胎发育相关基因的表达.

分类号： Q785%S828

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