蛋鸡资源群体的盲肠长度全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王星果

作者： 王星果;曲亮;卢建;窦套存;马猛;胡玉萍;沈曼曼;郭军;李尚民;王克华

作者机构：

关键词： 蛋鸡;盲肠长度;GWAS;遗传结构

期刊名称： 西南大学学报(自然科学版)

ISSN： 1673-9868

年卷期： 2018 年 09 期

页码： 35-41

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】盲肠是鸡进一步消化和吸收养分,尤其是纤维的器官,对鸡的生长及后期产蛋都具有重要作用,因此鸡的盲肠长度是一个重要的生理指标.【方法】通过对白来航鸡与东乡绿壳蛋鸡杂交所得F2代个体的盲肠长度进行测量,并运用单核苷酸多态性(SNP)芯片检测其基因分型,根据SNP检测数据运用SAS进行遗传评估,并用全基因组混合模型关联算法(GEMMA)进行单变量全基因组关联分析(GWAS).【结果】结果显示,盲肠长度表现出中等遗传力(0.39).GWAS鉴定出54个SNP与盲肠的长度显著相关,且1号染色体170 Mb附近对于盲肠长度来说是一个重要区域.在这个区域,覆盖26个SNP位点的18个基因被定为候选基因,其中2个分别在编码序列(CDS)和3'非翻译区(3'UTR),对应于NHLRC3和SIAH3,它们可能是影响盲肠长度的重要SNP位点和基因.【结论】利用GWAS筛选并鉴定出和鸡盲肠长度相关联的SNP位点及基因,将为揭示蛋鸡盲肠发育的机制和分子育种提供基础.

分类号： S831.2

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