中国玉米审定品种标准SSR指纹库的构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王凤格

作者： 王凤格;杨扬;易红梅;赵久然;任洁;王璐;葛建镕;江彬;张宪晨

作者机构：

关键词： 玉米;品种鉴定;DNA指纹库;SSR

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2017 年 50 卷 01 期

页码： 1-14

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】对数量庞大的已知玉米品种构建可共享的作物品种标准DNA指纹库。【方法】基于荧光毛细管电泳检测平台和植物品种DNA指纹库管理系统,利用筛选的40对SSR核心引物对3 998份中国玉米审定品种标准样品进行建库,通过多实验室、多检测平台进行建库数据的质量评估。【结果】绘制了40个玉米建库引物的等位基因频率分布图作为每个引物的特征图谱,在建库试验中发挥了相当于参照样品的作用。形成了一套十重荧光毛细管电泳组合,并在SSR指纹分析器中建立了一套系统默认PANEL作为不同实验室建库时的标准PANEL。统计玉米审定品种指纹库构建的试验情况,每份样品具有2—5套原始试验数据及对应的指纹图谱,其中61%的样品做了2组独立试验,33%的样品做了3组独立试验,最终建成的标准指纹库累计缺失和差异位点仅占0.2%,数据完整性达到99.8%。在不同实验室、不同电泳检测平台的评估结果表明,同一荧光电泳检测平台上获得SSR指纹数据一致性高,而不同的电泳检测平台获得的数据存在一定偏差,为实现不同实验室的SSR指纹数据共享,需要统一荧光引物、分析软件及电泳检测平台。对所有审定品种指纹数据进行整体两两比较,表明中国玉米审定品种之间差异比较大,品种间差异位点百分比集中在80%—95%(占78.28%),品种间差异位点百分比在50%以上的已达到99.21%,而低于20%的只有0.09%;对玉米审定品种杂合率水平进行分析,平均品种杂合率达到64%,主要集中在50%—80%(占89%)。通过玉米品种标准指纹比对服务平台(网址:http://www.maizedna.org/)实现了指纹库的共享。【结论】形成了构建作物品种SSR指纹库的标准化程序,构建了3 998份玉米审定品种的SSR指纹库,通过多实验室联合比较试验,保证建库数据的准确性和数据库的可共享性;建立了玉米品种标准指纹比对服务平台网站,实现玉米审定品种指纹库在全国种子检验系统的共享。

分类号： S513

  • 相关文献

[1]中国玉米新品种DNA指纹库建立系列研究 Ⅲ.多重PCR技术在玉米SSR引物扩增中的应用. 王凤格,赵久然,佘花娣,郭景伦,陈刚,廖琴,孙世贤,陈如明. 2003

[2]我国玉米品种标准DNA指纹库构建研究及应用进展. 赵久然,王凤格,易红梅,田红丽,杨扬. 2015

[3]中国玉米品种标准DNA指纹库构建研究进展. 赵久然,王凤格,郭景伦. 2004

[4]中国玉米新品种标准DNA指纹库构建研究的几点思考. 王凤格,赵久然,郭景伦,孙世贤. 2005

[5]分子标记技术在棉花品种鉴定上的研究进展. 杨伟华,许红霞,王延琴,周大云,冯新爱,王俊芳. 2009

[6]20个鲜食玉米杂交种DNA指纹库的构建. 韩晴,沈雪芳,陆卫平,王义发,彭日荷,姚泉洪. 2014

[7]农作物品种DNA指纹库构建研究进展. 王凤格,赵久然,田红丽,杨扬,易红梅. 2015

[8]玉米SSR-DNA指纹库构建方案在高粱中的通用性. 周青利,王蕊,张春宵,周海涛,易红梅,王凤华,李晓辉,田红丽,葛建镕,席章营,王凤格. 2017

[9]SSR分子标记技术及其在构建玉米DNA指纹库上的应用. 李秀平,姜丽静,刘娜. 2010

[10]基于辣椒品种鉴定的SSR核心引物筛选. 何建文,刘永翔,韩世玉,苏丹,朱英,刘作易. 2014

[11]SSR标记在玉米育种中的研究与应用. 朴红梅,王玉民,李万良,穆楠,尹航,王桂荣,孙敬. 2007

[12]利用SSR构建甜菜品种的分子身份证. 栗媛,王茂芊,邳植,吴则东. 2019

[13]梨品种SSR分子鉴定体系的建立及应用. 王斐,张艳杰,欧春青,李佳纯,杨冠宇,马力,姜淑苓. 2021

[14]甜樱桃品种SSR指纹检索系统的开发及遗传多样性分析. 张琪静,张新忠,代红艳,谷大军,闫桂军,李春敏,张志宏. 2008

[15]沃柑SSR分子标记筛选及其在品种鉴定上的应用. 黄其椿,卢东长城,陈东奎,江东,刘吉敏,谢健,施平丽,张兰,刘福平. 2020

[16]基于SSR标记的MCID法鉴定72个酿酒葡萄品种. 傅伟红,魏新科,葛孟清,刘崇怀,房经贵. 2019

[17]花菜类SSR分子标记筛选及其在品种鉴定上的应用. 褚云霞,邓姗,李寿国,刘丹,陈海荣,任丽,章毅颖,赵洪. 2022

[18]11个德国甜菜品种指纹图谱的构建. 吴则东,王华忠,马龙彪,王茂芊. 2013

[19]利用SSR标记鉴定柚和杂柑品种. 雷天刚,何永睿,吴鑫,刘小丰,许兰珍,彭爱红,陈善春. 2007

[20]基于荧光检测技术的小麦品种SSR鉴定体系的建立. 郑永胜,张晗,王东建,孙加梅,王雪梅,段丽丽,李华,王玮,李汝玉. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序