甜瓜内源病毒CmEV的TaqMan RT-qPCR检测方法研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 赵立群

作者: 赵立群;张晓飞;邱艳红;刘慧;张建;杨静静;张海军;徐秀兰;温常龙

作者机构:

关键词: 甜瓜内源病毒;TaqMan探针法荧光实时定量PCR;葫芦科作物;种苗带毒

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2022 年 49 卷 011 期

页码: 2471-2478

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 甜瓜内源病毒(cucumis melo endornavirus,CmEV)是近年来发现的寄主广泛、发病率高、种传率高的重要病毒.利用CmEV基因组的序列信息设计特异性引物和探针,建立基于探针法的实时荧光定量 PCR(Real-Time Fluorescent Quantitative PCR with TaqMan probes,TaqMan RT-qPCR)的检测方法.该方法可以检测出1×10-2ng·μL-1的RNA和1.8×103 copies·μL-1的质粒,灵敏度是普通PCR的100倍.利用该方法检测了在北京、山东、辽宁、海南瓜类种苗主产区的甜瓜、西瓜、黄瓜与南瓜砧木11份种苗带毒情况,发现山东和海南各有1份甜瓜种苗携带CmEV.本研究建立的CmEV TaqMan RT-qPCR方法特异性好、灵敏度高,可为开展病毒精准鉴定、科学防控以及从源头遏制病毒传播提供技术支撑.

分类号: S652

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