玉米品种DNA指纹数据库构建的标准化规范

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王凤格

作者： 王凤格;赵久然;戴景瑞;郭景伦;原亚萍;王璐;易红梅;孙世贤;吕波

作者机构： 中国农业大学农学与生物技术学院;北京市农林科学院玉米研究中心;吉林大学植物科学学院;全国农技推广服务中心;农业部品种测试中心

关键词： 玉米;DNA指纹;数据库

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2007 年 5 卷 01 期

页码： 128-132

收录情况： CSCD

摘要： 为了保证玉米品种DNA指纹库构建的标准化,从建库标记、检测平台、试剂、样品、评估程序、数据整合、模式库、扩展库、随机盲测等九个方面进行了全面的规范:(1)通过对不同分子标记的比较,确定SSR标记作为建库标记;(2)通过对不同DNA指纹检测方法的比较,确定毛细管电泳结合多色荧光检测方法作为DNA指纹片段分析方法;(3)规范了DNA、引物、Taq酶等试剂质量,以保证数据的稳定性和可重复性;(4)规范了样品来源、样品类型及分析样品数量;(5)确定评估品种的数量及引物的取舍标准;(6)为解决不同来源DNA指纹数据的有效整合问题,提出了固定一套核心引物、提供标准品种、提供标准DNA、确定引物等位基因BIN、规定对异常带型数据处理方式、规定数据的编码方式等6个解决策略;(7)规范了构建模式库的材料名单、来源及构建方式;(8)规范了构建扩展库的材料来源及构建方式;(9)进行数据库数据随机盲测,以评估入库数据质量。以上规范将为不同单位合作开展大规模的DNA指纹库构建研究奠定基础。

分类号： S513

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