陆地棉突变体腺体形成时期的基因表达谱

文献类型: 中文期刊

第一作者: 陈敏

作者: 陈敏;江明锋;蔡应繁;孙全;何晓红;江怀仲;谢永芳;莫剑川;高运玲;潘正;陈珺;伍婷玉;王玲;朱小燕;张锐;袁友禄;石玉真

作者机构:

关键词: 棉花;棉酚;腺体形成;基因芯片;表达谱

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2010 年 26 卷 03 期

页码: 34-39

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解棉花腺体形成时期相关基因的表达谱,分别抽提陆地棉湘棉-18和N5在腺体形成时期的RNA,采用Affymetrix芯片,扫描采集数据后进行分析。结果显示,在腺体形成时期有明显差异表达的基因共有514条,包括209条上调基因和305条下调基因;在514条差异表达基因中有275条(53.5%)与GenBank中已知的基因具有较高的相似性,这些基因主要涉及防御反应及异戊二烯生物合成等,有239条(46.5%)在GenBank中无任何注释。KOBAS分析结果显示,这些差异基因在KEGG数据库上涉及19条生化途径。说明,腺体形成过程是一个复杂的基因网络调控过程,涉及多条萜类化合物生物合成途径及其他与防御基因相关的途径。

分类号: S562.01

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