陆地棉TRM基因家族的鉴定及纤维品质相关优异单倍型分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王凯迪

作者： 王凯迪;高晨旭;裴文锋;杨书贤;张文庆;宋吉坤;马建江;王莉;于霁雯;陈全家

作者机构：

关键词： 陆地棉;基因家族;基因表达;纤维品质;单倍型

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2024 年 61 卷 003 期

页码： 521-536

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]鉴定陆地棉TRM基因家族序列及理化性质,分析与棉纤维品质相关的优异单倍型基因差异.[方法]利用生物信息学分析陆地棉TRM基因家族进化关系、理化性质和聚类表达;利用基因单倍型效应分析筛选调控纤维品质性状(纤维长度、比强度、马克隆值)的候选基因.[结果]陆地棉TRM基因家族编码的氨基酸为376~1093,等电点为4.64~9.56.亚细胞定位预测发现多达60 个陆地棉TRM基因家族定位于细胞核中.TRM基因家族含有较多的光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关的元件.60 个TRM基因家族在纤维发育时期优势表达,调控棉花纤维发育.每个基因的单倍型个数为 1~8,并筛选到纤维长度、强度以及马克隆值相关的优异单倍型TRM基因分别有 14、18 和 15 个,其中有 11 个基因同时具有长度、强度、马克隆值3 种改良纤维品质的优异单倍型.GH_D09G0775 的Hap_4 单倍型和GH_D03G1434 的Hap_3 单倍型在增加纤维长度、强度的同时降低了马克隆值.[结论]在陆地棉(Gossypium hirsutum L.)中鉴定出75 个TRM基因家族成员分布在24 条染色体上,系统进化将其分为Cluster Ⅰ~Ⅲ3 个亚族.

分类号： S562

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