我国7个泥鳅群体遗传多样性的微卫星分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘洁

作者: 刘洁;高风英;卢迈新;陈刚;曹建萌;刘志刚;王淼

作者机构:

关键词: 泥鳅;微卫星;遗传多样性;遗传距离;多态信息含量(PIC)

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2019 年 27 卷 012 期

页码: 2101-2109

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 环境污染和人类活动使我国泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)资源量锐减,种质资源不断退化.为探索我国泥鳅不同地理群体的遗传多样性及种群遗传结构,本研究采用10个微卫星标记对鄱阳湖地区及珠江流域共7个泥鳅群体(鄱阳湖,英德,清远,连南,南雄,梅州,柳州)进行了遗传多样性分析.结果表明,各基因座的平均等位基因数(number of allele,Na)和有效等位基因数(effective number of allele,Ne)分别为7和2.5个,平均观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)和期望杂合度(expected heterozygosity,He)分别为0.3274和0.3960.7个泥鳅群体间的近交系数(population inbreeding coefficient,Fis)、遗传分化系数(genetic differentiation coefficient,Fst)和基因流(number of migrants per generation,Nm)分别为0.0930、0.3720和0.4221,表明7个群体间遗传交流水平低,存在较高程度的遗传分化.10对微卫星引物在7个群体中共扩增出79个等位基因,群体的Na为3.0~7.5个,Ne为1.7~5.5个,Ho为0.3074~0.5347,He为0.3290~0.8615,多态信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.3168~0.5294.7个泥鳅群体间的遗传距离为0.0453~1.6023,柳州与南雄群体遗传距离最小(0.0453),亲缘关系较近;清远与梅州群体遗传距离最大(1.6023),亲缘关系相对较远.基于遗传距离的聚类结果显示,柳州、南雄、连南和梅州群体聚为一个分支,而清远、英德和鄱阳湖群体聚为另一个分支.上述研究结果表明,目前我国泥鳅群体的遗传多样性处于中等水平,泥鳅群体间的遗传分化受自身迁移能力和地理隔离等因素的影响.本研究可为泥鳅良种基础群体的进一步选择及泥鳅种质资源的保护提供理论依据.

分类号: S917.4

  • 相关文献

[1]利用微卫星标记分析三个绵羊品种及杂交后代遗传多样性. 孙永锋,杨博辉,梁春年,孙伟丽,郎侠,刘建斌,曾玉峰,郭宪. 2007

[2]4个贵州乌骨鸡群体遗传关系的微卫星标记分析. 伍革民,张继,唐继高. 2018

[3]结合线粒体D-loop序列和SSR标记对宝石鲈养殖群体遗传多样性的分析. 赵立祥,董浚键,孙成飞,田园园,胡婕,卢迈新,叶星. 2019

[4]山西4个地方山羊品种的遗传多样性分析. 毛杨毅,罗惠娣,郭慧慧,王志武,李俊,张冠武,王栋才,李希,张喜忠,田辉. 2010

[5]6个绵羊品种微卫星多样性分析. 王亚磊,李静心,茆达干,王慧利,李隐侠,钱勇,孟春花,曹少先. 2014

[6]长江三角洲白山羊保种群体的SSR遗传多样性分析. 李丹阳,孙玲伟,吴彩凤,张树山,张德福,戴建军. 2021

[7]6个野鸭群体的遗传多样性及其与绍兴麻鸭的亲缘关系分析. 陶争荣,徐小钦,沈军达,李丽,曾涛,杜雪,董仕海,卢立志. 2016

[8]5个山羊品种的遗传结构及多样性研究. 武艳平,马月辉,韩俊文,赵倩君,何晓红,浦亚斌,关伟军,储明星,李奎. 2008

[9]罗氏沼虾6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析. 孙成飞,叶星,董浚键,田园园,梁健辉. 2015

[10]新疆南疆地区4个地方绵羊品种微卫星标记的遗传多样性分析. 赵冰茹,毋状元,董红,霍飞,陈童,罗永明,王岳强,季斐,郑新宝. 2020

[11]利用微卫星标记分析雁荡土鸡及其他3个鸡群体遗传多样性. 曾涛,孙思维,田勇,陈黎,卢立志,干贤通,干方本,吴春琴. 2017

[12]五指山猪近交家系Ⅰ系F19~F21群体微卫星位点等位基因遗传变化. 程文科,阮楠,牟玉莲,李奎,冯书堂. 2012

[13]西北肉用绵羊新品群陶滩寒组合的微卫星标记研究. 杨博辉,刘建斌,郎侠,郭健,孙晓萍,程胜利. 2008

[14]五指山猪近交家系Ⅰ系F_(19)~F_(21)群体微卫星位点等位基因遗传变化. 程文科,阮楠,牟玉莲,李奎,冯书堂. 2012

[15]五指山猪近交家系Ⅰ系F_(19)~F_(21)群体微卫星位点等位基因遗传变化. 程文科,阮楠,牟玉莲,李奎,冯书堂. 2012

[16]利用微卫星标记指导红鳍东方鲀亲本选配. 刘永新,刘奕,周勤,张红涛. 2015

[17]缙云麻鸭与绍兴鸭各品系的遗传距离分析. 刘玮孟,张静,卢立志,沈军达,王德前,李国勤,田勇,李进军,陶争荣. 2011

[18]金草鱼与中国4个草鱼群体的微卫星多态性比较分析. 朱冰,樊佳佳,白俊杰,姜鹏. 2017

[19]不等微卫星座位数目对Nei氏标准遗传距离估测精度的影响. 张爱玲,马月辉,陈秀梅,陈宏. 2005

[20]长江中下游以及东南沿海的7个山羊群体的遗传多样性分析. 汪志国,杨章平,马月辉,王庆华,毛永江,常洪,周群兰,许明. 2006

作者其他论文 更多>>