凡纳滨对虾TCP-1-eta基因的克隆及与耐寒性状的相关性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 殷勤

作者： 殷勤;彭金霞;崔亮;谢达祥;王志伟;李奎;陈晓汉

作者机构：

关键词： 凡纳滨对虾;TCP-1-eta;SNP;耐寒性状

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2011 年 33 卷 02 期

页码： 168-174

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理,文章克隆了凡纳滨对虾的耐寒相关基因TCP-1-eta并对其与耐寒性状的关系进行了研究。首先,根据电子克隆所得序列设计引物,采用RT-PCR方法克隆得到长1 705 bp的TCP-1-eta基因序列,其中包括1 629 bp的完整开放阅读框,编码542个氨基酸残基。然后,运用荧光定量PCR对TCP-1-eta基因进行时空表达谱的分析:(1)组织表达分析结果显示,该基因在凡纳滨对虾肌肉组织中表达量最高;(2)不同低温处理下的表达结果显示,该基因在15℃开始呈上调表达,13℃时表达量最高;(3)13℃低温处理的表达结果显示,该基因在36 h内呈小幅上调表达,但36 h后表达量显著升高,48 h表达量达到0 h的150倍。进一步采用PCR-RFLP方法对216只凡纳滨对虾TCP-1-eta基因进行了SNP多态性检测,并将其与耐寒性状进行了关联分析。在该基因编码区第731碱基上发现C/T突变,方差分析结果表明该位点的不同基因型与耐寒力指标CDH(Cooling-degree hours)值相关(P<0.05),其中CC基因型的耐寒能力比TT基因型强。

分类号： S917.4

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