辣椒基因组中XTH基因家族的鉴定与表达特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李宁

作者： 李宁;沈瑶;夏碧波;梁关生;吴智明;刘海清

作者机构：

关键词： 辣椒;木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶;基因表达;果实发育与成熟

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 317-324

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为全面了解木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了所有辣椒XTH基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域等进行了预测,同时基于转录组数据集分析了XTH基因在辣椒不同器官、不同发育时期果实中的表达特征。结果表明,辣椒XTH家族包含23个基因成员,不均衡分布在除10号染色体外的其余11条染色体上;23个基因包含1~5个不等的内含子;系统进化分析表明,辣椒XTH蛋白可分为3个亚家族;基因表达特征分析显示,大多数辣椒XTH的表达具有组织特异性,CaXTH2、CaXTH21、CaXTH13和CaXTH23极有可能与辣椒果实的膨大与成熟相关。本研究为深入了解辣椒XTH基因的功能奠定了基础。

分类号： S641.3

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