甘蓝型油菜角果长度性状的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙程明

作者： 孙程明;陈松;彭琦;张维;易斌;张洁夫;傅廷栋

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;产量;角果长度;关联分析;SNP标记

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2019 年 45 卷 09 期

页码： 1303-1310

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 角果长度是油菜重要的农艺性状,适度增加角果长度有利于扩大角果库容量,增加光合面积,提高油菜的籽粒产量。本研究利用Illumina60KSNP芯片对496份具有代表性的油菜资源进行基因型分析,考察群体在4个环境中的角果长度表型,利用MLM和GLM模型进行全基因组关联分析。结果表明, MLM模型检测到7个位点,联合解释25.01%的表型变异; GLM模型检测到25个位点,联合解释41.77%的表型变异。合并共同位点后得到27个位点,其中7个与前人报道的QTL重叠,其余20个是新鉴定的位点。效应最大的位点Bn-A09-p29991443位于A09染色体,在MLM和GLM模型中分别解释13.89%和12.86%的表型变异,携带其优异等位基因的材料平均角果长度增加0.89cm。同时,在该位点附近找到已克隆的油菜角果长度基因ARF18和BnaA9.CYP78A9。此外,在5个位点附近发现拟南芥已知角果长度基因GID1b、FUL、EOD3、DOF4.4和GA20ox1的同源拷贝。本研究结果有助于解析角果长度的遗传基础,为研究角果长度的调控机理,指导角果长度的遗传改良打下基础。

分类号： S565.4

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