广东番茄曲叶病毒G2分离物基因组DNA-A的分子特征
文献类型: 中文期刊
第一作者: 何自福
作者: 何自福;虞皓;罗方芳
作者机构:
关键词: 广东番茄曲叶病毒;DNA-A;序列分析;分子特征
期刊名称: 微生物学报
ISSN: 1005-7021
年卷期: 2005 年 45 卷 01 期
页码: 48-52
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 从采集于广东的番茄曲叶病病株上分离到病毒分离物G2 ,序列分析结果表明 ,其DNA_A为单链环状 ,全长2 74 4nt,共有 6个ORF ,其中病毒链上编码AV1(CP)、AV2 ,互补链上编码AC1、AC2、AC3和AC4。BLAST结果显示 ,与G2基因组有同源关系的病毒均属双生病毒科菜豆金色花叶病毒属。序列比较结果显示 ,G2与菜豆金色花叶病毒属病毒的DNA_A序列同源率均不超过 83% ,其中同源率最高的是PaLCuCNV_[G10 ](82 8% )。进一步比较发现 ,它们的基因间隔区 (IR)变异最大 (同源率为 30 9%~ 81 8% ) ;CP氨基酸序列的同源率较高 (77 6 %~ 99 2 % ) ,AC4蛋白氨基酸序列的同源率较低 (4 3 5 %~ 78 8% )。系统进化关系分析结果也显示 ,G2与已报道的菜豆金色花叶病毒属病毒的亲缘关系均较远。因此 ,G2可能是双生病毒科菜豆金色花叶病毒属中一个未报道的新种 ,命名为广东番茄曲叶病毒 (TomatoleafcurlGuangdongVirus ,ToLCGDV)
分类号: S432.4
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