瘤胃微生物RNA提取中样品前处理方法的优化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘思佳

作者： 刘思佳;赵圣国;郑楠;王加启

作者机构：

关键词： 瘤胃液;前处理;破碎温度;RNA提取;优化;RNA质量

期刊名称： 微生物学杂志

ISSN： 1005-7021

年卷期： 2020 年 001 期

页码： 88-93

收录情况： CSCD

摘要： 通过优化瘤胃液前处理方法,提高瘤胃微生物RNA提取数量与质量.试验优化4个前处理条件,共组合形成5个处理组.前处理完成后,利用Trizol进行RNA提取,检测RNA浓度和完整度(RIN).结果显示,提取瘤胃内容物和瘤胃菌体RNA浓度和完整度的影响没有显著差异(P>0.05).液氮保存的样品提取的RNA浓度和完整度均显著(P<0.05)高于RNA保护液保存的样品.解冻处理对RNA浓度的影响无显著差异(P>0.05),但是不解冻处理提取的RNA完整度显著高于解冻处理(P<0.05).液氮冷冻研磨提取的RNA浓度(P<0.05)显著高于常温研磨,但是对RNA完整度的影响没有显著差异(P>0.05).瘤胃内容物、液氮速冻、不解冻处理结合冷冻研磨方法所提取RNA的RIN值为9.43,完整度最高.瘤胃内容物、液氮速冻、解冻离心收集菌体结合冷冻研磨方法所提取的RNA浓度为1 048 ng/μL,为最高浓度.因此,瘤胃内容物直接液氮速冻并在不解冻条件下冷冻研磨,所提取的RNA效果最好,可用于后续宏转录组学试验.

分类号： S852.6

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