2015年~2020年江西地方鸡种禽圆环病毒2型流行病学调查与全基因组进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张帆帆
作者: 张帆帆;傅金根;黄奕雯;罗士仙;涂凌云;方绍培;吴玲;张危红;康冬柳;康昭风
作者机构:
关键词: 禽圆环病毒2型;流行病学调查;进化分析
期刊名称: 中国预防兽医学报
ISSN: 1008-0589
年卷期: 2022 年 012 期
页码: 1332-1337
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解江西地区禽圆环病毒2型(AGV2)的流行情况及基因组的遗传进化关系,本研究利用PCR方法对2015年~2020年间采自江西各地区的1 372份地方鸡血清、粪便及内脏组织样品进行AGV2检测。结果显示,江西地区AGV2的阳性率为13.99%(192/1 372),其中育成鸡阳性率最高,为17.16%(98/571),且各生长阶段鸡AGV2阳性率均有逐年升高的趋势。从中选取12份AGV2阳性样品进行全基因组扩增,并对其全基因组序列和VP1蛋白序列进行同源性及遗传进化关系分析,同时对VP1蛋白线性抗原表位进行预测分析。结果显示:选取的12个AGV2全基因组之间的同源性为96.8%~99.8%,其中VP1基因序列的同源性在96.5%~99.9%,氨基酸序列同源性在99.4%~100%;遗传进化分析显示,12个AGV2全基因组分布于进化树的各分支,具有遗传多样性的特征;进一步分析发现AGV2 VP1蛋白氨基酸序列的突变并未导致VP1蛋白疏水性的改变,仅JX201601 VP1出现G36S突变,JX201802 VP1出现Q222R突变,致使VP1蛋白抗原性改变。本研究首次明确了江西地方鸡种中AGV2的流行状况和遗传演化特点,为江西地区AGV2感染的防控提供了重要数据支撑。
分类号: S852.65
- 相关文献
[1]我国东北部分地区牛溶血性曼氏杆菌的分子流行病学研究. 姜志刚,李奕欣,于力. 2020
[2]江苏省羊肠道病毒感染的流行病学调查. 蔡旭航,李文良,李基棕,李思远,毛立,许信刚,李彬. 2024
[3]怀化市仔猪黄白痢的调查及分析. 胡辉,胡艳,邓治邦. 2010
[4]贵州黔东南州部分县市猪附红细胞体病流行病学调查. 陈坚,徐洪忠,肖芳萍,李庭章,龙鹏远,龙宗康,杨海. 2008
[5]贵州省铜仁地区猪附红细胞体病流行病学调查. 徐洪忠,肖芳萍,李家国,罗华国,喻兵,李明举,李森,郝金昌. 2008
[6]贵州省猪戊型肝炎的分子流行病学调查. 任荣清,张登祥,徐景峨,杨茂生,王祥兴. 2011
[7]东北地区猪群链球菌分离鉴定及流行病学调查分析. 王淑杰,雷连成,徐敏,孙长江,李成君,蔡雪辉,刘永刚,张琦,刘狄热,石文达. 2009
[8]我国部分地方鸡种禽白血病流行病学调查. 范建华,戴有理,俞燕,高明燕,韦玉勇,屠云洁,陈彤,苏一军,徐步. 2016
[9]我国奶牛普通病的危害特点与防治对策. 严作廷,陈炅然,王东升. 2013
[10]2013年内蒙古地区蓝舌病流行情况调查. 张胜男,吕建华,常建华,韩明浩,刘昆,海岩,刘威,吴树清. 2014
[11]2015年内蒙古地区蓝舌病及流行性出血热流行病学调查及血清型鉴定. 张胜男,李华春,朱建波,李乐,苗海生,肖雷,寇美玲,吴树清,常建华. 2016
[12]2011—2017年浙江省猪病毒性腹泻病的流行病学调查. 徐丽华,李军星,苏菲,余斌,王赛,田瑞雨,袁秀芳. 2018
[13]内蒙古部分地区规模化牛场常见寄生虫的流行病学调查. 聂福贵,尹相吉,钱英红,郭少平,陈湘江,徐跃峰,杨晓野,王瑞. 2018
[14]黑龙江省同江市一起牛炭疽疫情的紧急流行病学调查. 郭永丽,张君,张加勇,钟映梅,苏景,王新,孙刚. 2019
[15]近年来福建省鸡传染性鼻炎的流行病学调查. 林琳,江斌,吴胜会,张世忠. 2017
[16]保定地区羔羊大肠杆菌病的流行病学调查与治疗. 张婷,李金贵,刘茂军,郑世学,马玉忠. 2021
[17]浙江地区猪圆环病毒2型检测及遗传变异分析. 徐丽华,蓝胜芝,余斌,李军星,张鹏超,李宝臣,苏菲,袁秀芳. 2020
[18]一起羊附红细胞体病流行病学调查治疗报告. 范坤江,何立雄,张元静,邱国斌,李胜,张星星,韩猛立,杨浩可,陈朝阳,吾山,陈新华. 2020
[19]浙江省某地区保育猪群呼吸道疾病综合征现场调查与诊治. 刘爱军,赵灵燕,李军星,周彩琴,张红丽,倪柏峰,黄晓兵,徐辉. 2019
[20]山西省奶牛乳腺炎流行病学调查研究. 武守艳,董春光,韩文儒,杨丽华,刘文俊,陈剑波,韩一超. 2018
作者其他论文 更多>>
-
添加不同复合菌对黑水虻幼虫粉发酵产物组成的影响
作者:黄欣;吴玲;谷青青;曹凡;柯裴蓓;陈燕;郭聪;金雨晴;李玉娟
关键词:黑水虻幼虫粉;复合菌;脂肪酸;氨基酸
-
草莓组培苗不定根响应羧基化碳纳米管处理的转录组分析
作者:曹凡;陈燕;谷青青;郭聪;吴玲;徐秋霞;黄欣;李玉娟
关键词:红颜草莓;碳纳米管;转录组测序;植物组织培养
-
耐盐促生菌发酵对黑水虻虫粪组成及其应用效果的影响
作者:黄欣;谷青青;吴玲;曹凡;金雨晴;陈燕;郭聪;柯裴蓓;李玉娟
关键词:黑水虻虫粪;耐盐促生菌;发酵;有机肥;白菜
-
转录组和代谢组联合分析植物呈色机制研究进展
作者:郭聪;金雨晴;王莹;柯裴蓓;陈燕;吴玲;黄欣;徐秋霞;谷青青;曹凡;李玉娟
关键词:转录组;代谢组;呈色机制;研究进展;联合分析
-
猪丁型冠状病毒编码蛋白结构与功能研究进展
作者:陶丽寒;林翠;吴诚诚;康昭风;黄建珍
关键词:猪丁型冠状病毒;编码蛋白;分子机制;抗病毒药物
-
宿主miR-124在病毒感染中的调控机制及功能研究进展
作者:柳玉新;吴诚诚;徐俊;宋德平;张帆帆
关键词:miR-124;病毒复制;免疫应答;靶向治疗
-
叶面硒强化对辣椒硒累积及其营养品质的影响
作者:聂根新;陈徐俊;涂田华;邬磊;黄启华;吴玲;卢坚雯;周瑶敏
关键词:辣椒;叶面喷硒;营养品质;连续采摘
