野生大豆抗胞囊线虫基因SHMT的序列多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 袁翠平

作者： 袁翠平;赵洪锟;王玉民;刘晓冬;齐广勋;董英山

作者机构：

关键词： 野生大豆;大豆胞囊线虫;SHMT;序列多样性

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2014 年 36 卷 06 期

页码： 755-760

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大豆丝氨酸羟基转移酶(serine hydroxymethyltransferase)基因(SHMT)是Rhg4位点的抗胞囊线虫基因。本研究根据基因序列设计PCR引物对92份野生大豆进行了扩增,并对扩增产物测序,研究了其遗传多样性及其与大豆对胞囊线虫抗性的关系,旨在为野生大豆资源的合理利用提供参考。在供试的92份野生大豆SHMT序列(2 430bp)中,共发现了13个SNP位点(7个转换,6个颠换)和4个Indel(均发生在非编码区),其中11个为简约信息位点;SHMT序列多样性为π=0.000 61和θ=0.001 06;多态性位点形成16个单倍型,其中9个单倍型的分布频率>2%,单倍型多样性为0.855;Tajima’s D、Fu and Li’s D和Z检验发现野生大豆SHMT不存在选择压力;卡方测验表明野生大豆SHMT与大豆对胞囊线虫的抗性没有直接关联;采用UPGMA法构建的SHMT分子进化树表明,供试92份野生大豆被聚类在6个类群,并表现出种质间的遗传关系与其生态区有一定的联系。

分类号： S565.1

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