基于WGCNA挖掘谷子淀粉合成相关基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡萌萌

作者： 胡萌萌;张丽玲;张雅坤;郄倩茹;任碧云;侯思宇;朱喆标;高建华;王海岗;李旭凯;韩渊怀

作者机构：

关键词： 谷子;淀粉;Waxy基因;WGCNA

期刊名称： 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-8151

年卷期： 2021 年 41 卷 001 期

页码： 11-19

摘要： [目的]淀粉是植物发育过程中重要的能源物质,也是影响作物品质的重要物质之一.明确谷子淀粉合成调控相关基因对于开展谷子品质分子育种具有重要意义.[方法]本试验对谷子及其它5种禾本科作物直链淀粉合成关键基因Waxy进行聚类,并对其基因特征进行了分析;对Waxy基因在谷子中的表达模式进行分析;以名优谷子品种晋谷21为材料,构建淀粉合成相关基因的共表达网络.[结果]确定了6个物种中Waxy氨基酸序列系统发育关系、基因结构及蛋白基序,明确了Waxy蛋白具有糖基转移酶(GT_1)和淀粉合成酶催化区(GT_5)2个保守性结构域;确定了Si4g02980基因是谷子籽粒淀粉合成的主效基因.WGCNA筛选出含淀粉合成相关基因数目较多的2个模块,确定了一批包括转录因子的候选基因.[结论]本研究结果可为进一步鉴定和克隆谷子淀粉合成调控关键基因及谷子品质分子育种提供理论支撑.

分类号： S515

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