文献类型： 中文期刊
第一作者： 丁戈
作者： 丁戈;黄杨;陈伦林;李书宇;宋来强;熊洁
作者机构：
关键词： 甘蓝型油菜;内参基因;转录组测序;实时荧光相对定量PCR;表达稳定性分析;铝胁迫
期刊名称： 华北农学报
ISSN：
年卷期： 2021 年 001 期
页码： 1-9
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了研究甘蓝型油菜在铝胁迫条件下内参基因的稳定性,在受到主要铝毒害的根组织内发掘新内参基因,以甘蓝型油菜耐铝品种赣油杂7号和铝敏感品种蓉油18的苗期根组织为研究材料,对营养液培养的试验材料分别设置对照组（0 h）和2个时间梯度（3,24 h）的铝胁迫（100μmol/L AlCl3,pH值4.5）处理组。首先,采用有参考基因组的转录组测序技术（RNA-seq）及FPKM值差异基因表达分析,筛选出符合持家基因特征的5个候选内参基因（Actin7、ARFA1E、SAP5、UXS3、UBC9）。随后,依次进行实时荧光相对定量PCR分析,扩增曲线和熔解曲线分析,LinRegPCR扩增效率分析,geNorm、NormFinder和BestKeeper基因表达稳定性分析,REST 2009相对表达量分析等分析步骤。结果表明,新设计开发的5对候选内参基因引物特异性高。从转录组测序数据中筛选出的4个候选内参基因（Actin7、ARFA1E、SAP5、UXS3）的表达稳定性获得了验证。按表达稳定性的综合排名由高至低排序依次为UXS3、SAP5、ARFA1E、Actin7,其中最优组合为SAP5和UXS3。综上所述,本研究开发的候选内参基因引物特异性高,可以提高铝胁迫试验体系实时荧光相对定量PCR试验的准确性,新发掘的内参基因（Actin7、ARFA1E、SAP5、UXS3）,可以作为铝胁迫试验体系实时荧光相对定量PCR试验的新内参基因。
分类号： S565.4
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