枇杷WRKY基因家族鉴定及其表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张雅玲
作者: 张雅玲;邓朝军;苏文炳;陈秀萍;蒋际谋;郑少泉
作者机构:
关键词: 枇杷;WRKY;基因家族;表达分析;果皮着色
期刊名称: 福建农业学报
ISSN: 1008-0384
年卷期: 2025 年 40 卷 005 期
页码: 487-499
摘要: 【目的】系统分析枇杷(Eriobotrya japonica)WRKY基因家族成员(EjWRKY),为解析其在果皮着色过程中的生物学功能奠定基础。【方法】基于枇杷基因组数据,采用生物信息学方法鉴定枇杷EjWRKY基因家族,并对其理化性质、系统进化和结构特征等进行全面分析。同时,结合转录组测序技术,比较分析‘解放钟’和‘山牌3号’枇杷果皮着色过程中EjWRKY基因的表达情况,并采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术对部分差异表达基因的进行试验验证。【结果】鉴定出100个具有典型结构域的WRKY,命名为EjWRKY1~EjWRKY100。WRKY长度150~732 aa,分子量介于17 189.36~79 765.13 Da,等电点(isoelectric point, pI)介于4.92~10.25。亚细胞定位预测结果表明,绝大多数亚细胞定位于细胞核。染色体定位分析显示,其中97个WRKY基因不均匀地分布在17条染色体上。根据WRKY结构域和锌指基序可将枇杷EjWRKY分为3个大类。多数EjWRKY基因在解放钟和山牌3号枇杷果皮中均有表达。EjWRKY基因的qRT-PCR分析结果与转录组数据一致。【结论】鉴定出100个枇杷EjWRKY家族基因,并发现其中部分基因的表达模式与枇杷果皮着色过程显著相关,为进一步研究EjWRKY基因调控枇杷果皮色素合成的分子机制奠定基础。
分类号: S667.3
- 相关文献
[1]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016
[2]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023
[3]苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,董庆龙,周宗山. 2015
[4]板栗WRKY基因家族鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析. 赵爽,葛朝红,石鹤飞,闵卓,王广鹏,李伟明. 2024
[5]百脉根WRKY基因家族生物信息学分析. 马培杰,李亚娇,舒健虹,王小利. 2023
[6]丝瓜WRKY转录因子基因的分离与褐变分析. 刘建汀,朱海生,温庆放,王彬,张前荣,陈敏氡,林珲,薛珠政. 2017
[7]葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析. 苏玲,王鹏飞,杨阳,任凤山,王咏梅,陈万钧. 2019
[8]铝胁迫下金沙柚3个WRKY基因的生物信息学与表达分析. 刘召亮,万水林,闫承璞,王雨亭,胡钟东. 2019
[9]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019
[10]基于转录组的百香果ARF基因家族的鉴定及表达分析. 张小雪,韦晓霞,陈发兴. 2021
[11]甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析. 侯黔东,沈天娇,余欢欢,仇志浪,文壮,张惠敏,吴亚维,文晓鹏. 2021
[12]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[13]菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析. 阮城城,胡福初,罗志文,王祥和,郭利军,李玉静,范鸿雁,韩冰,陈哲,张治礼. 2020
[14]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017
[15]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022
[16]巴西橡胶树FKBP基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018
[17]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019
[18]石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析. 骆翔,曹尚银,李好先,赵弟广,张富红,陈丽娜,Krishna Poudel,敬丹,唐丽颖. 2020
[19]荔枝GA2ox基因家族的鉴定及表达分析. 陈哲,王祥和,周文静,周瑞云,吴文碟,吴凤芝,范鸿雁,胡福初. 2021
[20]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021
作者其他论文 更多>>
-
云南屏边枇杷产业现状、问题与发展对策
作者:陈友祥;张雅玲;郑健;左艳秀;陈德香;王思云;王绍昌;邓朝军;张惠云;罗心平;郑少泉
关键词:云南;屏边;枇杷;错季栽培;产业现状;发展对策
-
基于图像识别的枇杷资源果肉褐变鉴定方法研究与应用
作者:陈宇佳;邓朝军;张婷婷;王秀平;陈秀萍;赵加宁;马翠兰;蒋际谋
关键词:枇杷;果肉褐变;图像分割;鉴定评价
-
泸州龙眼种业现状与品种结构调整建议
作者:毛海啸;李景明;李小孟;曾云;祝进;胡文舜;邓朝军;丁晓波
关键词:龙眼;泸州;品种结构;成熟期;发展建议
-
云南屏边白肉枇杷新品种"三月白"引种试验
作者:陈友祥;张雅玲;罗心平;张惠云;郑健;左艳秀;王思云;邓朝军;郑少泉
关键词:“三月白”;枇杷;引种;云南屏边;“大五星”
-
外源褪黑素对新白8号枇杷果实日灼和果皮解剖结构的影响
作者:高雨薇;邓朝军;许奇志;李浩伟;项于倩;马翠兰;蒋际谋
关键词:枇杷;褪黑素;日灼;果皮;解剖结构
-
"贵妃"枇杷高产高效栽培技术
作者:许奇志;邓朝军;蒋际谋;洪桂霖
关键词:枇杷;栽培技术;高产;高效
-
优质大果中熟白肉枇杷新品种-中白
作者:蒋际谋;郑少泉
关键词:
