茄子AP2/ERF转录因子的鉴定及胁迫条件下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邵欣欣

作者： 邵欣欣;李涛;李植良;宇丽;黎振兴

作者机构：

关键词： 茄子;AP2/ERF转录因子;生物信息学分析;表达分析;逆境胁迫

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2015 年 11 期

页码： 1901-1918

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物AP2/ERF是一个庞大的转录因子家族,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在茄子基因组范围内,利用生物信息学方法对茄子AP2/ERF转录因子家族的成员、分布及结构和功能等进行分析。结果表明,茄子AP2/ERF家族包含130个蛋白质,其中AP2、RAV、ERF亚家族分别含有20、2和108个,ERF分为DREB/CBF(41个成员)和ERF(67个成员)两大亚族,进化分析将二者分为11个小亚族。MEME分析表明其含有20个重要基序,相同亚族中的ERF成员蛋白序列的氨基酸保守域构成相似,且各亚族成员的氨基酸保守域组成类似,表明这些基序的存在对ERF蛋白功能的执行是必需的。利用实时荧光定量PCR对茄子38个ERF基因进行组织表达分析,结果表明其存在组织表达差异;胁迫响应分析结果表明,33个基因受ABA、SA、盐、重金属镉、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,可能参与茄子逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为茄子AP2/ERF家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析AP2/ERF基因功能奠定基础。

分类号： S641.1`Q943.2

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