湖南省南方水稻黑条矮缩病毒分离物组分S10编码的ORF序列克隆与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李兴华

作者： 凌晓曦;张松柏;张德咏;刘勇

作者机构：

关键词： 南方水稻黑条矮缩病毒;湖南分离物;组分S10;克隆与分析

期刊名称： 植物保护

ISSN： 0529-1542

年卷期： 2015 年 02 期

页码： 135-138+141

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR方法扩增并克隆了2013年湖南省水稻上发生的南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice blackstreaked dwarf virus,SRBSDV)S10片段的近全长序列,采用生物信息学软件Mega、RDP和DnaSP分析其编码的开放阅读框(open reading fragment,ORF)遗传多样性。结果表明:2013年湖南省15个SRBSDV分离物S10编码的ORF序列同源性在99.5%以上,不同分离物中存在3~30个突变位点,绝大部分的核酸突变为无义突变,没有发现可能的重组。在系统发育树上,15个分离物聚类为2个分支,其中湖南汉寿的10个分离物和永州的2个分离物(HuNyz12和HuNyz29)与我国浙江分离物聚为1个亚组、湖南永州的其他3个分离物与我国南部的云南、海南等及越南的分离物聚为1个亚组。系统发育结果表明,SRBSDV随传毒介体白背飞虱迁飞从我国南部向北部扩散。

分类号： S435.111.4

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