蒙古冰草XTH基因生物信息学及干旱胁迫下表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈艺豪
作者: 陈艺豪;房永雨;范菠菠;张学峰;赵彦;闫秀秀;吴婧;翟永青;于卓;马艳红
作者机构:
关键词: 蒙古冰草;XTH;生物信息学分析;基因表达
期刊名称: 中国农业大学学报
ISSN: 1007-4333
年卷期: 2025 年 30 卷 001 期
页码: 55-64
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为筛选出蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)抗旱相关的XTH基因,利用生物信息学方法对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、进化关系及二、三级结构进行分析,并对4个抗旱相关的XTH基因进行表达分析。结果表明:筛选得到的7个蒙古冰草XTH基因,蛋白大小位于70~357 aa,分子质量为7.67~39.46 ku,理论等电点(PI)在4.67~9.81,均为亲水性蛋白;亚细胞定位表明AmXTH-1定位在细胞壁和细胞质,其余6个定位于细胞壁。XTH基因的二、三级结构以无规则卷曲为主,推测motif1、motif2和motif3为保守基序。进化关系比对发现AmXTH30、AmXTH28-1、AmXTH-1和AmXTH8-1与已知具有抗旱功能的基因具有较高相似性。qRT-PCR分析表明,4个与蒙古冰草抗旱相关的XTH基因均呈下调表达。推测蒙古冰草中差异表达的4个XTH基因在响应干旱胁迫中起负调控作用。
分类号: S543.9
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