低温胁迫下海滨木槿的转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵文静
作者: 赵文静;郑旭;葛金涛;刘兴满;缪美华;孔祥伟
作者机构:
关键词: 海滨木槿;低温胁迫;转录组;差异基因;耐寒
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2023 年 005 期
页码: 56-64
收录情况: 北大核心
摘要: 海滨木槿(Hibiscus hamabo Sieb.et Zucc.)是一种典型的耐盐植物,甚至能够在海水中生长,是沿海滩涂绿化的绝佳绿化树种,但在栽培试验中发现海滨木槿不耐寒,很难在北方地区越冬。为探究海滨木槿在低温胁迫下的分子应答机制,挖掘海滨木槿的抗寒基因,培育耐寒海滨木槿,通过转录组测序(RNA-seq)的试验方法分析海滨木槿在低温胁迫下的差异基因表达情况。试验结果表明,低温胁迫下的处理组与常温对照相比,共有23 689个差异表达基因,其中上调表达基因10 256个,下调表达基因13 433个。通过GO富集分析,发现差异基因大多富集在代谢过程、细胞过程、膜、催化活性等方面;通过KEGG的富集分析,发现这些差异基因大多富集在代谢途径、次生代谢物的生物合成、光合作用、植物昼夜节律、植物激素信号转导等方面,本研究还筛选了一些潜在的耐寒差异基因,如FKF1、GI、PYL、PP2C、CML、CPK、SNRK2、NCED和BIN2等。本试验结果可为研究海滨木槿的耐寒机制以及培育海滨木槿耐寒品种提供技术参考和基础。
分类号: S685.99
- 相关文献
[1]木豆响应低温胁迫差异表达基因分析. 唐军,丁西朋,陈志坚,马向丽,毕玉芬,郭凤根. 2022
[2]糙皮侧耳发酵玉米秸秆转录组揭示木质素降解相关途径. 马蕊,赵飞,范寰. 2017
[3]干旱胁迫下两个玉米自交系雄穗花器官分化期的转录组分析. 王业建,杨杰,梁晓玲,阿布来提·阿布拉,韩登旭,郗浩江,刘俊,李铭东. 2020
[4]茶树叶片响应茶饼病侵染的转录组分析. 孙云南,许燕,冉隆珣,蒋会兵,宋维希,夏丽飞,陈林波,梁名志. 2020
[5]镉胁迫下西瓜的转录组测序分析. 王志伟,李涵,邹甜,孙波,孙小武. 2018
[6]大肠杆菌O157:H7生物被膜状态下基因表达分析. 马蓝,彭晴,徐小轻,杨硕,张宇微,田丹丹,施琳波,石波,乔宇. 2023
[7]低温胁迫下枇杷不同发育阶段的花果转录组比较分析. 徐红霞,周慧芬,李晓颖,姜路花,陈俊伟. 2021
[8]基于转录组测序的紫芽茶树花青素合成相关基因分析. 蒋会兵,夏丽飞,田易萍,戴伟东,陈林波. 2018
[9]不同品种茶树新梢响应"倒春寒"的转录组分析. 王君雅,陈玮,刘丁丁,陈亮,姚明哲,马春雷. 2019
[10]通过嫁接传染的不同阶段黄龙病对椪柑转录组的影响. 王茜,陈东奎,黄宏明,廖惠红,李一伟,刘福平,汪妮娜. 2020
[11]不同品种茶树新梢响应“倒春寒”的转录组分析. 王君雅,陈玮,刘丁丁,陈亮,姚明哲,马春雷. 2019
[12]基于RNA-Seq鉴定不同石榴品种间果实糖酸代谢基因. 冯立娟,付莹,王传增,杨雪梅,尹燕雷,陶吉寒. 2022
[13]低温胁迫下苦瓜叶片转录组差异基因分析及生理响应特征. 杜文丽,陈中钐,许端祥,徐同伟,高山,温庆放. 2021
[14]低温诱导稻曲病菌菌核形成的转录组学分析. 吕楚阳,邓平川,张晓丽,孙钰超,梁五生,胡东维. 2020
[15]低温胁迫下两叶一心期棉花叶片的生理响应和转录组分析. 王晓曼,王琼珊,王孝刚,张教海,张友昌,张兴中,别墅,夏松波. 2020
[16]紫花苜蓿响应低温胁迫转录因子的鉴定及表达分析. 齐晓,闵学阳,张正社,孙启忠,刘文献. 2017
[17]基于转录组分析筛选凡纳滨对虾低温胁迫下的差异表达基因. 董丽君,孟宪红,孔杰,罗坤,栾生,史晓丽. 2019
[18]转录组和蛋白质组关联分析解析巴西蕉幼苗响应低温的分子机制. 林蔚,吴水金,李跃森. 2024
[19]水稻幼苗期低温胁迫的生理响应及转录组分析. 郭慧,李树杏,甘雨,张宏伟,郝留根,杨占烈,向关伦,王珍珍,易崇粉. 2023
[20]猕猴桃'脐红'与'徐香'越冬期转录组的比较分析. 毛可欣,王海荣,安淼,吕巍,李健,李国田. 2023
作者其他论文 更多>>
-
湿润剂对育苗基质水分吸持和黄瓜穴盘苗生长的影响
作者:郑旭;张爱爱;尚庆茂
关键词:育苗基质;粒径;湿润剂;黄瓜;穴盘苗
-
洋葱转录组测序及黄酮类化合物合成相关基因的分析
作者:陈微;潘美红;惠林冲;李威亚;缪美华;何林玉;杨海峰
关键词:洋葱;鳞茎;转录组;黄酮类化合物;花青素
-
40个木槿品种耐涝性评价
作者:赵文静;闫红民;郑旭;王晓晓;刘兴满;缪美华
关键词:木槿;Hibiscus syriacus;耐涝性;淹水胁迫
-
江苏耐盐观赏园林植物的良种选育及其盐碱地造林技术
作者:张立伟;马慧慧;唐坤;嵇东;相建华;刘兴满
关键词:耐盐观赏园林植物;良种选育;盐碱地;土壤改良;造林技术
-
不同秸秆还田方式玉米田双斑萤叶甲和瓢虫发生动态
作者:赵秀梅;王立达;郑旭;李青超;王连霞;兰英;刘悦;刘洋;刘颖;王振营
关键词:双斑萤叶甲;异色瓢虫;黄色粘虫板;玉米田;秸秆还田方式
-
基于转录组的洋葱bHLH转录因子家族鉴定与生物信息学分析
作者:陈微;潘美红;惠林冲;李威亚;郇国磊;何林玉;缪美华;陈振泰;杨海峰
关键词:洋葱;bHLH;转录因子;生物信息学分析
-
湿润剂对基质水分吸持和白菜穴盘苗生长的影响
作者:郑旭;张宗俭;段韫丹;张爱爱;张棣莛;尚庆茂
关键词:基质;灌溉;育苗;湿润剂;水分吸持;白菜穴盘苗