牛GDF8基因编码蛋白结构和功能预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵拴平

作者： 赵拴平;金海;徐磊;贾玉堂

作者机构：

关键词： 牛;GDF8;生物信息学;蛋白结构

期刊名称： 中国草食动物科学

ISSN： 1002-6037

年卷期： 2023 年 43 卷 002 期

页码： 33-36

摘要： 旨在探究GDF8基因(Growth differentiation factor 8)编码蛋白的结构和功能,对后期研究其生理机制提供理论依据.利用生物信息学技术对牛GDF8蛋白二级和三级结构进行了预测,分析了保守结构域、信号肽剪切位点、理化性质、亲疏水性、亚细胞定位和蛋白网络通路.结果显示,牛GDF8蛋白与人和小鼠具有相似的保守结构域,不稳定指数85.52,属于不稳定蛋白,其亲水性氨基酸明显多于疏水性氨基酸,为亲水性蛋白;牛GDF8蛋白在内质网分布的概率44.4%,在线粒体分布的概率33.3%,二级结构以无规则卷曲为主,折叠缠绕后形成三级结构;牛GDF8蛋白PPI网络图有11个节点,其KEGG通路主要与骨骼肌纤维发育、活化素受体信号通路、成肌细胞融合等相关.综上,推测GDF8蛋白存在于内质网和线粒体中,通过与亲水性蛋白结合调节机体生物学功能.

分类号： S823.2

  • 相关文献

[1]中国荷斯坦牛红毛基因变异及其编码蛋白结构预测. 李秋玲,李建斌,张争锋,王洪梅,高运东. 2008

[2]山羊紧密连接相关蛋白ZO-1序列的生物信息学分析. 王梦雅,赵学亮,徐明,李洋,宋利文,高峰,胡红莲,高民. 2018

[3]辽宁沈阳株猫泛白细胞减少症病毒VP2基因扩增及生物信息学分析. 刘琪,刘正伟,梁琳,张利,郝春晖,李玥,赵福庆. 2024

[4]牛RXRG基因cDNA的克隆及生物信息学分析. 黄萌,许尚忠,昝林森,高雪,陈金宝,任红艳. 2008

[5]牛miR-320a的靶基因预测及生物信息学分析. 郭云涛,张秀秀,苗向阳. 2015

[6]基于生物信息学对牛CAPN1基因的SNPs筛查与验证. 高雪,吴慧光,许尚忠,陈金宝,任红艳. 2009

[7]牛白细胞介素1受体相关激酶2(IRAK2)基因的克隆及生物信息学分析. 王兴平,罗仍卓么,许尚忠,高雪,李俊雅,任红艳,陈金宝. 2009

[8]南阳牛BoLA-DRA基因编码区生物信息学分析. 楚秋霞,陈付英,王志方,冯亚杰,徐照学,王荷香. 2013

[9]牛FAS基因的生物信息学分析. 焦斐,阎萍,梁春年,郭宪,包鹏甲,裴杰,丁学智,褚敏,吴晓云,刘建. 2011

[10]牛MED28基因编码区克隆、生物信息学分析及组织表达谱研究. 李晋男,王亚慧,邓天宇,梁忙,杜丽丽,李柯安宁,薛青青,骞里,高雪,张路培,朱波,陈燕,王泽昭,李俊雅,高会江. 2024

[11]肉用绵羊2号染色体GDF8区域4种微卫星标记多态性研究. 宋彦红,石国庆,柳楠,代蓉,任航行,刘国庆. 2007

[12]4个绵羊品种GDF8基因多样性检测. 潘磊,王一民,石国庆,楼纪东,管峰. 2009

[13]GDF8基因研究进展. 赵拴平,金海,徐磊,贾玉堂. 2022

[14]柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析. 李玉萍,王欢,武松,夏润玺,刘彦群,秦利,李喜升,姜德富. 2009

[15]剂量率对辐照牛血清蛋白生化特性和结构的影响. 耿胜荣,鉏晓艳,李新,白婵,李海蓝,叶丽秀,廖涛. 2017

[16]垂穗披碱草MADS-box基因WM8克隆及分析. 张妙青,张吉宇,刘志鹏,王彦荣,张磊. 2012

[17]秘鲁鱿鱼肌原纤维蛋白凝胶的构效关系研究. 林伟伟,励建荣,潘伟春,傅玉颖,李昂. 2017

[18]昆虫嗅觉相关可溶性蛋白的研究进展. 张玉,杨斌,王桂荣. 2019

[19]中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析. 秦梦雪,刘庆慧,万晓媛,黄捷. 2017

[20]环糊精水解酶cds1-3底物通道氨基酸的定点突变研究. 汤宏赤,莫莉,闭海,林丽华,郭媛,庞浩. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序