中国荷斯坦牛ABCG2基因编码区多态性检测及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 路国彬

作者： 路国彬;李宏滨;李玉荣;牛丽莉;任航行;杜立新

作者机构：

关键词： 中国荷斯坦牛;ABCG2基因;多态性;生物信息学分析

期刊名称： 生物技术通讯

ISSN： 1009-0002

年卷期： 2009 年 20 卷 06 期

页码： 818-822

摘要： 目的:研究中国荷斯坦牛ABCG2基因编码区(CDS)多态性,并进行生物信息学分析。方法:以中国荷斯坦牛为材料,利用PCR-SSCP技术对ABCG2基因CDS多态性进行检测,然后预测蛋白质序列的改变,并用生物信息学软件对蛋白质序列突变前后的结构及性质进行分析。结果:在外显子9中存在一个A→G碱基突变,导致氨基酸由酪氨酸突变为半胱氨酸,将此突变命名为Y367C;在外显子14中存在一个G→A突变,导致氨基酸由精氨酸突变为谷氨酰胺,将此突变命名为R578Q。2个突变一个位于功能区与跨膜区之间,一个位于跨膜区。生物信息学分析发现,蛋白质二级结构增加了1个卷曲(C)和2个转角(T),同时减少了3个β折叠(E),且ABCG2蛋白的组成和一些性质也发生了改变。结论:检测到的2个单核苷酸多态性引起了ABCG2蛋白性质和二级结构的改变;为进一步研究ABCG2蛋白对产乳性状的影响奠定了基础。

分类号： S823

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