番茄GAD基因家族鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 安翠环

作者： 安翠环;黄春贵;郭泽安;甘桂云;荆子桓

作者机构：

关键词： 番茄;GAD基因家族;生物信息学分析;蛋白结构;组织特异性表达;启动子元件

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2025 年 52 卷 006 期

页码： 41-51

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]植物谷氨酸脱羧酶(GAD)在γ-氨基丁酸(GABA)的生物合成中起关键作用,参与植物生长发育及逆境响应过程,但番茄GAD基因家族成员的功能分化和具体的分子调控网络仍未被揭示.旨在系统解析番茄GAD基因的生物学功能,为其在分子机制研究及遗传改良中的应用提供理论依据.[方法]通过生物信息学手段对番茄GAD基因家族成员进行染色体定位、基因结构、亲缘关系及组织特异性表达等分析.[结果]从番茄基因组中鉴定到5个GAD基因,分别位于1、3、4、5和11号染色体上,均具有典型的内含子-外显子结构.其编码的番茄GAD蛋白均为不稳定蛋白,主要定位于细胞质,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,活性中心及关键功能域进化上高度保守.番茄GAD基因与水稻、拟南芥同源基因序列相似性较高,但关键功能域存在特异性氨基酸变异.在广西野生番茄'G173'中,GAD基因在根、茎、叶中均未检测到表达,而在花和果实中表达存在显著差异,其中Solyc01G00002和Solyc04G001008在花中表达量较高,Solyc03G002270在花和果实中的表达量接近.[结论]番茄GAD基因在基因结构和蛋白性质上存在显著差异,包含多个保守功能结构域.番茄GAD与拟南芥、水稻等物种GAD基因的同源关系较近,且在根、茎、叶、果实等不同组织中均呈现特异性表达模式,表明该基因家族可能广泛参与番茄的生长发育过程.

分类号： S641.2

  • 相关文献

[1]茶翅蝽非典型气味受体基因的克隆及其生物信息学特征和组织特异性表达分析. 李秋霖,赵吉兰,田嘉慧,王源秀,张金平,杨世勇. 2020

[2]柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析. 李玉萍,王欢,武松,夏润玺,刘彦群,秦利,李喜升,姜德富. 2009

[3]水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析. 范冰峰,李文,刘理想,赵向远,邵静,林乐丰,孙慧敏,张旭林,许保增. 2023

[4]谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析. 赵艳,瓮巧云,马海莲,宋晋辉,袁进成,王凌云,董志平,刘颖慧. 2016

[5]谷子蔗糖合成酶基因家族鉴定及生物信息学分析. 王凌云,郭明,赵艳,瓮巧云,马海莲,宋晋辉,袁进成,董志平,刘颖慧. 2017

[6]玉米CCT基因家族的鉴定与生物信息学分析. 郭栋,杜媚,周宝元,高卓晗,曹哲统,赵明. 2019

[7]番茄WOX转录因子家族的鉴定及其进化、表达分析. 李晓旭,刘成,李伟,张增林,高晓明,周慧,郭永峰. 2016

[8]甘薯、番茄和拟南芥中丝氨酸羟甲基转移酶基因家族功能研究. 赵玉琪,周志林,唐君,姚改芳,胡康棣,张华. 2022

[9]葡萄转录因子数据库中17个MADS-box成员在果实发育成熟过程中的表达特征分析. 崔梦杰,王晨,吴伟民,王洁,汤崴,张文颖,朱旭东,贾海锋,沈文彪,房经贵. 2017

[10]银杏C2H2型锌指蛋白家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 李建阳,熊思微,李贺勤,崔鹏,贺炳. 2024

[11]大果水晶梨褐色果皮突变体木质素合成相关基因的组织特异性表达分析. 刘炳旭,于凤鸣,张立彬,武军凯,宋立琴,肖啸,杜晓东. 2016

[12]鸭RIG-1基因的组织表达及体外抗禽流感病毒活性研究. 张雅春. 2014

[13]虎皮鱼热激蛋白PtHsp70基因序列与低温表达分析. 刘丽丽,王晓雯,朱建亚,张蓉,朱华,田照辉. 2019

[14]甘蓝型油菜BnRRS1-like和BnRRS2-like抗病基因表达特征及进化分析. 张姗姗,高亚婷,李晋,郭亚娇,杜春芳,王景雪. 2021

[15]大菱鲆MHCⅡB基因全长CDNA的克隆与组织表达分析. 张玉喜,陈松林. 2006

[16]虎皮鱼PtScd1基因序列、功能与表达分析. 刘丽丽,张蓉,王晓雯,朱华. 2020

[17]玉米ZmSUT4-J基因的克隆与植物表达载体构建. 贺红霞,陈亮,康爽,林春晶,李楠. 2015

[18]橡胶树水通道蛋白基因HbPIP1和HbPIP2的功能鉴定及其表达分析. 王进,安锋,蔡秀清,邹智,张薇,林位夫. 2014

[19]乳蛋白基因结构及乳腺生物反应器研究进展. 刘明军. 1998

[20]水稻OsGLYI11.2基因启动子的克隆及表达分析. 刘圣杰,赖剑云,刘文华,刘勤坚,陈沛,张文虎,朱庆锋,肖应辉,刘军. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序