浅色黄姑鱼线粒体16S rRNA基因片段序列特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 童馨

作者： 童馨;杜博;喻达辉;龚世园;郭奕惠;黄桂菊;李莉好

作者机构：

关键词： 浅色黄姑鱼;线粒体16s rRNA基因;序列分析;RFLP

期刊名称： 海洋水产研究

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2007 年 28 卷 03 期

页码： 87-93

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16SrRNA基因片段序列,得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR-RFLP分析结果显示,两个种群的100个样品中98%的个体为其中一种单倍型,只有2%的个体呈另一种单倍型,表明这两个种群的遗传多样性较低。两个单倍型平均碱基组成为:T22.0%,C26.3%,A29.8%,G21.9%,GC含量平均为48.2%。与GenBank中石首鱼科7属9种的11条同源序列比对,得到429个比对位点,其中包括69个简约信息位点、55个单突变子和16个插入/缺失位点。聚类分析显示,浅色黄姑鱼与黄姑鱼亲缘关系较近,与形态分类相符。

分类号： S917.4

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