金鱼源维氏气单胞菌JY01全基因组测序及生物信息分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴尉凤

作者： 吴尉凤;饶秋华;柯文辉;刘洋;卓艺蓉;郑欣欣;罗土炎

作者机构：

关键词： 金鱼;维氏气单胞菌;全基因组测序;基因注释

期刊名称： 福建农业科技

ISSN： 0253-2301

年卷期： 2021 年 52 卷 007 期

页码： 18-25

摘要： 维氏气单胞菌(Aeromonasveronii JY01)是从福州某养殖场内金鱼烂尾、腐皮和溃疡等病灶处分离出的1株革兰氏阴性优势菌.为了解其基因组结构及功能特征,基于IlluminaPE150和Pacbio测序平台对维氏气单肥菌菌株JY01进行全基因组测序,并对测序数据进行组装和组分分析,利用生物信息学手段进行基因预测与功能注释、同时预测致病因子和耐药基因.结果 表明:维氏气单肥菌菌株JY01基因组序列长度为4.97 Mb,GC含量为58.17%;共预测到4601个编码基因、31个rRNA、16个基因岛及124个tRNA;其中,3461个基因在COG中获得注释,3082个基因聚集到GO聚类分析中,4345个基因在KEGG代谢通路中富集,预测维氏气单胞菌菌株JY01携带13种毒力因子包含240个相关毒力基因及9大类抗生素耐药性包含175个抗生素耐药基因.

分类号： S943

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