一年生辣椒(Cpsicum annuum L.)与中华辣椒(Cpsicum chinense Jacquin)DNA甲基化多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李涛

作者： 李涛;徐小万;李颖;李明珠;王恒明;徐晓美;罗少波

作者机构：

关键词： 辣椒;表观遗传多样性;DNA甲基化;MSAP

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2014 年 12 卷 02 期

页码： 306-315

收录情况： CSCD

摘要： 本研究调查了一年生辣椒和中华辣椒种的DNA甲基化多样性。选取了24个一年生辣椒栽培种和6个中华辣椒栽培种作为研究对象,采用MSAP(methylation-sensitive amplification polymorphism)技术对其基因组CCGG位点的甲基化多样性进行了分析。结果表明,从63对MSAP引物中筛选出5对重复性好、条带清晰的引物对,对30份辣椒种质基因组DNA进行MSAP扩增,得到939条带谱,其中多态性条带937个,多态性比例高达99.79%。DNA甲基化模式分析表明,类型Ⅰ为非甲基化带型(3721),类型Ⅱ为半甲基化带型(3152),类型Ⅲ为全甲基化带型(3839),辣椒甲基化模式主要以全甲基化为主,一年生辣椒(Capsicum annuum L.)和中华辣椒(Capsicum chinense Jacquin)甲基化条带平均分别为319和217,其扩增位点的甲基化率分别77.24%和63.64%,差异达极显著水平。基于相似性系数的UPGMA法聚类分析,在0.68相似水平可以将30个种质分为3个类,第1类:No.10~No.13和No.15共5个种质,其中No.10为一年生辣椒,其它4个为中华辣椒;第2类:No.2~No.9、No.14、No.16~No.30,其中No.14和No.17为中华辣椒;第3类:只有No.1,为一年生辣椒。应用MSAP未能将一年生辣椒和中华辣椒区分开来,表明辣椒表观遗传十分丰富。Nei's基因多态性指数(h)和Shannon信息指数(I)在2个栽培种中分别为0.204 0和0.329 8、0.186 4和0.297 5,一年生辣椒的表观遗传多样性稍高于中华辣椒。DNA甲基化多样性作为标志遗传多样性的一种信号源,本研究结果为深入探讨辣椒种群分化及物种进化奠定了基础。

分类号： S641.3

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